在劳动仲裁中，如果实际工作地和发工资的公司不是一个单位，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。具体仲裁策略需根据实际的法律关系来确定被申请人，并收集充分的证据以支持仲裁请求。以下是从不同角度的详细分析：

一、可能涉及的法律关系及被申请人确定

1. 劳务派遣关系：

   • 法律关系分析：在劳务派遣中，劳务派遣单位是劳动者的用人单位，负责工资发放、社保缴纳等；而实际用工单位则是劳动者提供劳动的地方。
   • 被申请人确定：根据法律规定，劳务派遣单位和用工单位在劳动争议中可作为共同当事人。因此，劳动者因劳动报酬、工作条件、工伤待遇等问题产生争议时，可将两者作为共同被申请人申请仲裁。

2. 关联公司混同用工情况：

   • 法律关系分析：关联公司间可能存在人员、财务、业务等方面的交叉或混同，导致劳动者难以明确自己的用工单位。
   • 被申请人确定：若能证明存在混同用工，劳动者可将相关关联公司列为共同被申请人。仲裁过程中需提供充分证据，如工作安排记录、工资发放流水、社保缴纳记录等，以证明混同用工事实。

3. 非法转包、分包关系：

   • 法律关系分析：在建筑工程等领域，承包单位可能非法将工程转包或分包给不具备用工主体资格的组织或个人。
   • 被申请人确定：劳动者可将具备用工主体资格的承包单位列为被申请人申请仲裁。

二、仲裁申请的具体步骤

1. 明确被申请人：根据上述法律关系分析，确定具体的被申请人，可能是劳务派遣单位、实际用工单位、关联公司或承包单位等。

2. 收集证据材料：

   • 劳动关系证明：如劳动合同、工作证、考勤记录等，以证明与被申请人之间的劳动关系。
   • 工资发放证明：如工资条、银行工资发放记录等，以证明工资发放情况。
   • 其他相关证据：根据具体仲裁请求提供相关证据，如加班记录、辞退通知、工作安排记录等。

3. 提交仲裁申请：

   • 向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请，并按照要求填写申请书，附上相关证据材料。
   • 管辖权确定：通常向劳动合同履行地（即实际工作地）或用人单位所在地（即公司注册地或主要办事机构所在地）的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如双方分别向两地申请，则由劳动合同履行地的仲裁委员会管辖。

4. 等待审理与裁决：

   • 仲裁委员会将对申请进行审理，并根据事实和法律作出裁决。
   • 若裁决结果有利，劳动者可依据裁决书要求相关单位履行义务；若不服裁决，可在规定时间内向人民法院提起诉讼。

三、注意事项与建议

1. 优先选择劳动合同履行地申请仲裁：这有助于降低沟通成本和出庭不便，因为劳动者更熟悉实际工作地的情况，也更容易获取相关证据和证人。

2. 确保证据的合法性、真实性和关联性：证据是仲裁胜诉的关键，劳动者应仔细收集并整理相关证据，确保它们能够支持自己的仲裁请求。

3. 考虑法律援助或咨询：如果劳动者对仲裁程序或法律条款不熟悉，可以联系当地法律援助机构或专业律师（如我）寻求帮助，以提高仲裁胜诉率。

在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同。因此，如果你面临类似问题，建议直接向我咨询，以便我能根据你的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。