针对您提出的问题“员工工伤治疗结束但是还没有做工伤鉴定，公司可以提出不续签合同吗”，以下是我的详细解答：
一、总体原则与法律依据
根据《劳动合同法》第四十二条以及《工伤保险条例》的相关规定，员工在工伤治疗期间及后续恢复阶段，特别是当工伤情况尚未明确（即未进行工伤鉴定）时，公司不能简单地以合同到期为由提出不续签合同。这是因为工伤员工在此期间享有特殊的法律保护，以确保其权益不受侵害。
二、具体情形分析
工伤治疗期间（停工留薪期）：
- 在员工因工作遭受事故伤害或患职业病需要暂停工作接受治疗的停工留薪期内，公司不仅不能提出不续签合同，还应继续支付员工原工资福利待遇。
- 如果劳动合同在此期间到期，公司应续延至停工留薪期满，以保障员工在治疗和恢复期间的权益。
工伤鉴定前：
- 在员工工伤治疗结束但尚未进行工伤鉴定的情况下，公司同样不能提出不续签合同。因为工伤鉴定结果是确定员工应享受工伤待遇的重要依据，也是判断员工是否丧失或部分丧失劳动能力、是否需要特殊保护的关键。
- 在此期间，公司应等待工伤鉴定结果出来后，再根据员工的伤残等级和具体情况来决定是否续签合同。
工伤鉴定后：
- 如果工伤鉴定结果显示员工为一级至四级伤残，员工将保留劳动关系并退出工作岗位，享受相应的工伤保险待遇。此时，不存在劳动合同到期不续签的问题。
- 如果鉴定为五级、六级伤残，员工同样保留与公司的劳动关系。除非员工本人提出解除或终止劳动关系，否则公司不能以劳动合同到期为由不续签合同。
- 如果鉴定为七级至十级伤残，公司在劳动合同到期时虽然有权选择不续签，但必须按规定支付一次性伤残就业补助金等费用。同时，如果员工存在其他特殊保护情形（如女职工在孕期、产期、哺乳期等），公司仍不得因劳动合同到期而终止劳动合同。
三、公司违法不续签的法律责任
如果公司违反相关法律法规规定，在员工工伤治疗结束但尚未进行工伤鉴定的情况下提出不续签合同，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司承担相应的法律责任。这包括但不限于经济补偿、赔偿损失等。
四、建议与总结
建议公司：
- 在处理员工工伤及合同续签问题时，务必谨慎行事，遵守相关法律法规规定。
- 等待工伤鉴定结果出来后，再根据员工的伤残等级和具体情况来决定是否续签合同。
- 如果决定不续签合同，应确保按照法律规定支付相应的费用，并妥善处理与员工的劳动关系。
总结：
- 员工工伤治疗结束但尚未进行工伤鉴定时，公司不能提出不续签合同。
- 公司应等待工伤鉴定结果出来后，再根据员工的伤残等级和具体情况来决定是否续签合同。
- 如果公司违法不续签合同，员工有权依法维护自身权益。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时告诉我。