结论：员工因生病不能胜任工作且未到合同期离职时，是否需要赔偿公司，需根据具体情况判断，一般而言，若员工主动辞职且无法证明公司存在违法行为，则无需赔偿公司；但若公司违法解除劳动合同，则需支付赔偿金。以下是对此问题的详细分析：
一、员工主动辞职的情况
一般原则：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，员工因个人原因（如生病不能胜任工作）主动辞职时，通常无需向公司支付赔偿金。这是因为辞职是员工的权利，而非义务，除非劳动合同或公司规章制度中有特别约定。
特殊情况：
- 如果员工在辞职时，能够证明公司的某些行为（如未提供必要的劳动条件、未按时支付工资等）迫使其辞职，那么员工可能有权要求公司支付经济补偿。但这种情况并不常见，且需要员工提供充分的证据。
二、公司解除劳动合同的情况
医疗期内的保护：
- 员工在患病或非因工负伤期间，享有法定的医疗期。医疗期内，公司不得随意解除劳动合同。如果公司在医疗期内解除劳动合同，属于违法解除，需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。
医疗期满后的处理：
- 医疗期满后，如果员工仍不能从事原工作，也不能从事由公司另行安排的工作，公司可以解除劳动合同，但需支付经济补偿金。经济补偿金的计算标准通常为按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
违法解除的后果：
- 如果公司未依法进行调岗或培训，或未在医疗期满后按照法定程序解除劳动合同，而是直接辞退员工，那么公司的行为可能构成违法解除。此时，员工可以要求公司继续履行劳动合同；如果不要求继续履行或劳动合同已无法继续履行，公司需按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。
三、实际操作建议
保留证据：
- 员工应保留好医疗证明、劳动合同、工资单等相关证据，以便在需要时维护自己的权益。这些证据在申请劳动仲裁或提起诉讼时至关重要。
了解法律途径：
- 如果公司拒绝支付合理的离职补偿或存在其他违法行为，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在劳动仲裁过程中，员工需要提供充分的证据来支持自己的主张。
协商与调解：
- 在采取法律行动之前，员工可以尝试与公司进行协商或寻求工会、第三方机构的帮助进行调解。协商和调解往往能够更快地解决问题，并减少双方的冲突和损失。
示例说明：
假设员工A因生病无法胜任原工作，且医疗期已满。公司未对A进行调岗或培训，而是直接辞退了A。在这种情况下，A有权要求公司支付经济补偿金，并可能因公司的违法解除行为而获得赔偿金。如果A选择主动辞职，且无法证明公司存在违法行为，则A无需向公司支付赔偿金。
后续思考依据：
在处理此类问题时，员工应充分了解自己的权益和公司的义务。如果员工对法律程序或自己的权益存在疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和帮助。