结论：工厂三天不来是否算自离，不能一概而论，这主要取决于工厂的规章制度以及劳动合同中的相关约定。
规章制度与劳动合同的约定
规章制度：
- 工厂通常会制定一系列的规章制度来管理员工，这些规章制度中可能包含了关于旷工、自离等情形的具体规定。
- 如果工厂的规章制度中明确规定，员工连续旷工达到一定天数（如三天）即视为自离，那么在这种情况下，员工三天不来工厂确实可能被认定为自离。
劳动合同：
- 劳动合同是员工与工厂之间约定双方权利和义务的法律文件。
- 如果劳动合同中明确约定了员工旷工达到一定天数即视为自离，或者约定了工厂有权因员工旷工而解除劳动合同，那么员工三天不来工厂也可能构成自离或导致劳动合同被解除。
法律后果与程序
自离的法律后果：
- 如果员工被认定为自离，工厂可能会根据规章制度或劳动合同的约定，不支付员工旷工期间的工资，甚至可能要求员工承担因自离给工厂造成的损失。
- 同时，自离也可能影响员工未来的就业和社保缴纳等权益。
解除劳动合同的程序：
- 即使工厂认为员工构成自离或严重违反规章制度，工厂在解除劳动合同时也需要遵循一定的法律程序。
- 例如，工厂需要事先将解除劳动合同的理由通知工会或员工本人，并听取其意见；在解除劳动合同时，需要出具解除劳动合同的证明，并在规定时间内办理档案和社会保险关系转移手续等。
建议与注意事项
查看规章制度与劳动合同：
- 员工在面临此类情况时，应首先查看工厂的规章制度和劳动合同中的相关约定，以了解自己的权利和义务。
与工厂沟通：
- 如果员工因特殊原因无法按时到岗，建议及时与工厂沟通并说明情况，以避免被误认为自离。
寻求法律帮助：
- 如果员工对工厂的认定或处理有异议，或者认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律帮助，如咨询律师或申请劳动仲裁等。
总结：工厂三天不来是否算自离，取决于工厂的规章制度和劳动合同中的相关约定。员工在面临此类情况时，应仔细查看相关约定，并与工厂进行沟通。如有必要，可以寻求法律帮助以维护自己的权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。