结论：劳动合同中约定每日工作8小时但实际安排工作12小时是否违法，不能一概而论，需结合用人单位实行的工时制度、是否获得劳动行政部门审批以及加班工资支付情况等多方面因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、标准工时制下的情况
在标准工时制下，根据《国务院关于职工工作时间的规定》及《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时（部分规定为40小时，但普遍以44小时为标准进行分析）。因此，如果劳动合同中约定的是标准工时制，但实际安排劳动者每日工作12小时，显然超出了法定工作时间，是违法的。
二、特殊工时制下的情况
特殊工时制包括不定时工作制和综合计算工时工作制，这两种工时制需要经劳动行政部门审批后方可实施。
综合计算工时工作制：
- 在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时，但总工时不应超过法定标准。
- 如果用人单位经过审批实行综合计算工时工作制，且在计算周期内总工时不超标，那么约定每日工作12小时（在特定周期内）可能是合法的。但超出正常工作时间的部分应认定为加班，用人单位需依法支付加班工资。
不定时工作制：
- 不定时工作制没有固定的工作时间限制，但企业仍需保障职工的休息休假权利，确保其身体健康。
- 如果用人单位经过审批实行不定时工作制，且能确保劳动者休息权利，那么约定每日工作12小时也可能被视为合法。但同样，超出正常工作时间的部分（如果存在可认定的“加班”情形）应依法支付加班工资。不过，不定时工作制下“加班”的认定通常较为严格，需根据具体情况判断。
三、加班工资支付情况
无论实行何种工时制，如果劳动者实际工作达到12小时，其中超出正常工作时间的部分一般应认定为加班。根据《劳动法》的规定，用人单位因生产经营需要延长工作时间的，应与工会和劳动者协商，并依法支付加班工资。具体标准为：
- 延长工作时间：支付不低于工资的150%的工资报酬；
- 休息日工作且不能安排补休：支付不低于工资的200%的工资报酬；
- 法定休假日工作：支付不低于工资的300%的工资报酬。
如果用人单位未依法支付加班工资，即使工时制度合法，也可能因违反加班工资支付规定而构成违法。
四、法律建议
- 核实工时制度：首先确认用人单位实行的是何种工时制度，并检查是否获得了劳动行政部门的审批。
- 检查加班工资支付：如果实际工作时间超过了约定或法定的工作时间，应检查用人单位是否依法支付了加班工资。
- 维护自身权益：如果发现用人单位存在违法行为，如未经审批实行特殊工时制、未依法支付加班工资等，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自身合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动法》第三十六条、第四十四条；
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三条；
- 《国务院关于职工工作时间的规定》第三条。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。