结论：公司让员工签订加班工资基数按最低工资标准来计算，员工可以主张不足额支付加班工资，但具体能否成功主张需视情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，加班工资的计算基数通常应按照劳动者正常工作时间工资来确定，而非最低工资标准。正常工作时间工资是指劳动者在法定工作时间内提供了正常劳动后，用人单位应当支付的工资报酬。如果劳动合同中约定的加班工资计算基数低于劳动者正常工作时间工资，或者用人单位单方面规定加班工资计算基数为最低工资标准，这种做法可能违反法律规定。
二、员工主张不足额支付加班工资的依据
劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了加班工资的计算基数，且该基数高于最低工资标准，那么员工可以依据合同约定主张不足额支付的加班工资。
法律规定：即使劳动合同中没有明确约定加班工资的计算基数，员工也有权依据法律规定，要求用人单位按照其正常工作时间工资作为加班工资的计算基数。如果用人单位实际支付的加班工资低于这一标准，员工可以主张不足额支付。
实际工资水平：员工还可以提供工资条、银行转账记录等证据，证明其正常工作时间工资水平，并据此主张加班工资的计算基数应高于最低工资标准。
三、可能面临的挑战与应对策略
劳动合同条款的合法性：如果劳动合同中确实约定了加班工资计算基数为最低工资标准，员工需要评估该条款的合法性。如果该条款违反了法律强制性规定，那么该条款可能无效，员工仍可以主张按照正常工作时间工资计算加班工资。
证据收集与保存：员工在主张不足额支付加班工资时，需要提供充分的证据来证明其正常工作时间工资水平以及加班事实。因此，员工应妥善保存工资条、银行转账记录、加班记录等证据。
协商与调解：在主张权利的过程中，员工可以先尝试与用人单位进行协商或寻求劳动调解机构的帮助，以达成和解协议。这有助于快速解决纠纷，减少诉讼成本。
法律途径：如果协商和调解无果，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求用人单位支付不足额的加班工资。
四、建议与总结
审查劳动合同：员工应仔细审查劳动合同中的相关条款，特别是关于加班工资计算基数的约定。如果发现条款违法或不合理，应及时与用人单位沟通并寻求修改。
增强法律意识：员工应增强自身的法律意识，了解自己的权益和义务。在遇到加班工资支付问题时，能够主动运用法律武器来维护自己的合法权益。
及时咨询与行动：如果员工对加班工资的计算基数有疑问或认为用人单位存在不足额支付加班工资的情况，应及时向我咨询并采取行动。不要拖延时间，以免错过维权时机。
总之，公司让员工签订加班工资基数按最低工资标准来计算的做法可能违反法律规定。员工在主张不足额支付加班工资时，应依据劳动合同约定、法律规定以及实际工资水平等证据来支持自己的主张。如有需要，请随时向我咨询相关法律问题。