结论前置：加班工资的计算基数并非直接等同于合同约定的地方最低工资标准，而是应依据劳动合同的约定、实际发放工资以及法律法规对工资组成的规定来确定，但该基数不得低于当地最低工资标准。
一、加班工资计算基数的法律依据
《中华人民共和国劳动法》第四十四条：
- 该条款明确规定了用人单位在安排劳动者加班时，应支付高于正常工作时间的工资报酬，具体为延长工作时间支付不低于工资的150%的工资报酬，休息日工作且不能安排补休支付不低于工资的200%的工资报酬，法定休假日工作支付不低于工资的300%的工资报酬。这为加班工资的计算提供了法律基础，但并未直接规定计算基数。
《工资支付暂行规定》第十三条：
- 该条款进一步细化了加班工资的计算方式，强调劳动合同规定的劳动者本人工资标准是加班工资计算的重要基数依据。同时，也规定了在实际操作中，如劳动合同未明确约定或约定不明确时，应如何确定加班工资的计算基数。
二、加班工资计算基数的确定原则
劳动合同约定优先：
- 若劳动合同中对劳动者的工资有明确约定，并且该约定不低于当地最低工资标准，则以此约定工资作为加班工资的计算基数。这包括基本工资、岗位津贴等固定组成部分。
实际发放工资次之：
- 在劳动合同未明确约定或约定不明确的情况下，应以实际发放的工资作为计算基数。但需注意，奖金、津贴等额外报酬通常不计入加班工资计算基数，除非这些报酬是劳动者正常劳动应得的一部分。
考虑最低工资标准：
- 若劳动者工资低于当地最低工资标准，则应以最低工资标准作为加班工资的计算基数。这是为了保障劳动者的基本权益，防止用人单位通过约定过低的工资标准来规避加班工资的支付义务。
三、特殊情况下的加班工资计算基数
计件工资：
- 对于实行计件工资的劳动者，加班工资计算基数为法定工作时间内的计件单价。这意味着，在计算加班工资时，应按照劳动者在法定工作时间内完成的计件数量所对应的单价来计算。
综合计算工时工作制：
- 在综合计算周期内，若总实际工作时间超过总法定标准工作时间，视为延长工作时间。此时，加班工资计算基数可以是综合周期内的月平均工资。但需注意，这种计算方式需经劳动行政部门批准实行综合计算工时工作制的企业才能采用。
四、实际操作中的建议
明确劳动合同约定：
- 用人单位在制定劳动合同和薪酬制度时，应明确加班工资计算基数的约定。这有助于避免因约定不明而引发的争议，并保障劳动者的合法权益。
保留相关证据：
- 劳动者在主张加班工资时，应提供充分的证据来证明自己的加班事实和工资情况。这包括劳动合同、工资条、加班记录等证据材料。
及时咨询与维权：
- 如遇到加班工资计算不合理的情况，劳动者应及时向相关部门投诉或寻求法律援助。作为专业律师，我建议劳动者在维权过程中保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。
综上所述，加班工资的计算基数是一个复杂而细致的问题，需综合考虑劳动合同约定、实际发放工资、最低工资标准以及特殊工资形式等多重因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。