当劳动合同没有明确加班费计算标准，只是约定按照不低于最低工资标准时，这确实属于约定不明。针对这种情况，以下是详细的分析和解答：
一、核心结论
在劳动合同中未明确约定加班费计算基数的情况下，应按照劳动合同中约定的工资标准（全面涵盖基本工资、绩效奖金、津贴等构成劳动者正常工作时间工资的所有部分）作为计算加班费的基数，且该基数不得低于当地最低工资标准。
二、法律依据与详细解释
《中华人民共和国劳动法》第四十四条：明确规定了加班费的支付标准，即按照不低于劳动者正常工作时间工资的工资报酬的一定比例支付。这里的“正常工作时间工资”即为加班费的计算基数。
约定不明时的处理：
- 当劳动合同中未明确约定加班费的计算基数时，应参照劳动合同中约定的工资标准来确定。这是因为劳动合同是双方权利和义务的协议，工资标准作为其中的重要内容，自然应成为计算加班费的基准。
- 同时，为确保劳动者的基本权益，无论采用何种基数计算加班费，都应确保最终的计算结果不低于当地最低工资标准。
案例支持：
- 如王力与汇博公司船员劳务合同纠纷案中，法院即根据相关法律法规的规定，结合实际情况，参照劳动合同中约定的工资标准作为计算加班费的基数。
三、特殊情况处理
- 如果用人单位与劳动者在劳动合同中约定了加班费计算基数，但该基数低于最低工资标准，那么该约定应属无效。因为这不仅违反了《中华人民共和国劳动法》的相关规定，也损害了劳动者的合法权益。在这种情况下，应按照劳动者的日常实际工资收入作为基数来计算加班费。
四、建议与总结
- 对于用人单位：建议在签订劳动合同时，明确约定加班费的计算基数，以避免未来可能出现的争议。同时，应确保该基数不低于当地最低工资标准，以保障劳动者的基本权益。
- 对于劳动者：应了解自己的合法权益，并在必要时积极维护自己的权益。如果用人单位未按规定支付加班费，劳动者有权向相关部门投诉或寻求法律援助。
综上所述，当劳动合同没有明确加班费计算标准时，应按照劳动合同中约定的工资标准作为计算基数，并确保该基数不低于当地最低工资标准。这一规定既符合法律法规的要求，也体现了对劳动者合法权益的保护。