结论前置：针对您提出的“员工提前40天提交离职申请并15天完成工作交接，但员工不走怎么办”的问题，这主要涉及到员工离职流程的合规性以及公司如何应对员工不按时离职的情况。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。
一、员工离职流程的合规性
离职申请的提交与审批：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，员工提前解除劳动合同应当提前三十日以书面形式通知用人单位。您提到员工提前40天提交了离职申请，这超出了法定通知期限，但并不影响离职申请的效力。关键在于，公司是否已经正式审批并接受了员工的离职申请。
- 如果公司已经审批并接受了离职申请，那么员工应当按照约定的时间（通常是三十日后）办理离职手续。
工作交接的完成：
- 您提到员工在15天内完成了工作交接。工作交接是离职流程中的重要环节，它确保了公司业务的连续性和稳定性。员工完成工作交接后，公司应当出具工作交接完成证明或类似文件，作为员工离职手续的一部分。
二、员工不按时离职的应对措施
与员工沟通：
- 首先，公司应当与员工进行沟通，了解员工不按时离职的具体原因。可能是员工对离职后的某些事项（如工资结算、社保转移等）存在疑虑或担忧。
- 通过沟通，公司可以解答员工的疑虑，消除员工的担忧，从而促使员工按时离职。
发送书面通知：
- 如果沟通无果，公司可以向员工发送书面通知，明确告知员工其离职申请已经得到批准，并要求员工按照约定的时间办理离职手续。
- 书面通知应当包含离职日期、离职手续办理流程、未按时离职的法律后果等内容，以确保员工清楚了解公司的要求和期望。
依据公司规章制度处理：
- 如果员工仍然拒绝按时离职，公司可以依据公司规章制度中的相关规定进行处理。例如，公司可以规定员工未按时离职将视为旷工，并按照旷工的相关规定进行处理（如扣除工资、解除劳动合同等）。
- 在处理过程中，公司应当确保规章制度的合法性和合规性，避免侵犯员工的合法权益。
寻求法律援助：
- 如果员工的不按时离职行为给公司造成了重大损失或影响，且公司无法通过上述措施解决问题，那么公司可以考虑寻求法律援助。
- 公司可以咨询专业律师，了解具体的法律途径和解决方案，如向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼等。
三、法律后果与风险提示
- 对于员工：如果员工未按时离职且违反了公司规章制度或劳动合同的相关规定，那么员工可能面临被扣除工资、解除劳动合同等法律后果。
- 对于公司：如果公司未能妥善处理员工不按时离职的问题，可能导致公司业务受到影响、员工关系紧张等不利后果。因此，公司应当积极采取措施解决问题，并确保处理过程的合法性和合规性。
最后建议：在处理员工不按时离职的问题时，公司应当保持冷静和理性，通过沟通、书面通知、依据规章制度处理等方式积极解决问题。如果问题无法得到妥善解决，公司可以考虑寻求法律援助以维护自身合法权益。如果您在处理过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。