您好，针对您提出的“吃饭超过三个月了，商家就不给开发票了，是否合理”的问题，我可以明确地告诉您，商家的这种做法是不合理的，也是违法的。

首先，根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项时，收款方有义务向付款方开具发票。这一规定并没有设定时间限制，也就是说，无论您是在三个月前、半年前还是更久之前在商家消费，只要您支付了款项，商家就有义务为您开具发票。

接下来，我建议您采取以下步骤来维护自己的合法权益：

1. 与商家沟通协商： 您可以先尝试与商家进行友好沟通，说明您需要发票的重要性，比如用于报销、记账等。同时，指出商家拒绝开具发票可能构成的违法行为，很多时候，问题可能因商家的疏忽或临时原因而未能及时解决，通过沟通往往能够达成和解。

2. 准备证据并向税务机关投诉： 如果与商家沟通无果，您应收集相关证据，如消费小票、支付记录（包括微信支付、支付宝支付等电子支付记录的截图，银行转账记录等）以及消费时的照片或视频等，以证明您在该商家进行了消费且未获得发票。随后，您可以通过拨打12366纳税服务热线或利用在线投诉渠道（如当地税务机关的官方网站或手机APP）向税务机关投诉，详细说明商家的名称、地址、消费时间和金额等信息，以及商家拒绝开发票的情况。

3. 向消费者协会投诉： 除了向税务机关投诉外，您还可以选择向消费者协会进行投诉。消费者协会会受理您的投诉，并协助您与商家进行协商和解决问题。如果协商无果，消费者协会还可以代表您向有关部门反映问题，进一步维护您的合法权益。

4. 法律途径维权： 若以上途径均无法解决问题，您还可以选择通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，您可以向法院提起诉讼，要求商家承担相应的法律责任，并赔偿因此给您造成的损失。在选择诉讼途径之前，建议咨询专业律师的意见，以确保诉讼行为的合法性和有效性。

总之，面对商家不开发票的情况，您应积极采取措施来维护自己的权益。无论是通过税务部门、消费者协会还是法律途径，都有相应的渠道和方法来帮助您解决问题。在此过程中，保持冷静、理性，并准备好充分的证据是关键。希望这些建议能对您有所帮助。