结论：员工离职后未归还备用金，公司若想起诉，一般应直接向法院提起民事诉讼，而非申请劳动仲裁。
分析说明：
劳动仲裁的适用范围：
- 劳动仲裁主要解决的是因劳动权利义务产生的争议，如劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止，以及劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训等事项。
- 在本案例中，员工未归还备用金的行为，并不直接涉及劳动合同的履行或劳动权利义务的争议，而是属于员工与公司之间的财产纠纷。
民事诉讼的适用性：
- 民事诉讼是解决平等主体之间因财产关系和人身关系产生的纠纷的一种方式。
- 员工未归还备用金，构成了对公司财产的侵占或不当得利，公司有权通过民事诉讼来追讨这部分财产。
具体操作建议：
- 公司应首先收集相关证据，如备用金的申请记录、使用记录、未归还的证明等。
- 然后，公司可以向有管辖权的法院提起民事诉讼，要求员工归还备用金及可能产生的利息或损失。
- 在诉讼过程中，公司应积极配合法院的调查和审理工作，提供必要的证据和材料。
特殊情况说明：
- 如果备用金的申请、使用或未归还行为与劳动合同的履行有直接关联，且该行为被明确规定在劳动合同或公司规章制度中作为违约行为或解除劳动合同的条件，那么公司可能可以先通过劳动仲裁来处理与员工的劳动合同关系，但最终追讨备用金仍可能需要通过民事诉讼来实现。不过，这种情况相对较少见，且需要具体分析劳动合同和公司规章制度的内容。
后续行动建议：
- 公司应尽快咨询专业律师，对备用金未归还的具体情况进行详细分析，以确定最合适的法律途径来追讨这部分财产。
- 同时，公司也应加强内部管理，完善备用金的申请、使用和归还制度，以避免类似情况的再次发生。
如有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。