核心结论：公司撤店导致劳动合同解除时，赔偿金的计算基数通常为劳动者离职前12个月的平均工资，该工资应包含提成等非固定收入部分，而非仅按保底工资计算。但具体需结合劳动合同约定、提成发放规则及地方性规定综合判断。以下分情况说明：

1. 经济补偿金的计算基数：包含提成

根据《劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入（《劳动合同法实施条例》第二十七条）。

• 提成属于工资组成部分：若提成是劳动者正常劳动的报酬（如销售提成、业绩奖金等），且已实际发放或符合发放条件（如已完成业绩目标），则应计入平均工资。
  
• 例外情形：若提成属于“风险性收入”（如未完成业绩则无提成），且劳动合同明确约定“提成不计入经济补偿基数”，则可能需结合地方规定判断是否有效。但实践中，此类条款易被认定为“免除用人单位法定责任、排除劳动者权利”而无效。

2. 赔偿金的特殊情形：违法解除时双倍计算

若公司撤店未依法履行程序（如未提前30日通知、未协商变更合同、未支付经济补偿等），可能构成违法解除劳动合同。此时，劳动者可主张赔偿金，标准为经济补偿金的两倍（《劳动合同法》第八十七条）。赔偿金的计算基数同样包含提成等工资组成部分。

3. 提成未发放或存在争议时的处理

• 已达成发放条件但未发放：若提成已符合合同约定或公司规章制度的发放条件（如已完成销售任务），但公司以撤店为由拒绝支付，劳动者可要求将未发放的提成计入平均工资。
  
• 未达成发放条件：若提成需满足特定条件（如客户回款、项目完成等），而撤店导致条件无法成就，则可能无法计入平均工资。但需注意，若撤店是公司主观原因导致条件无法成就，劳动者可主张公司承担不利后果。

4. 地方性规定的补充影响

部分地区对经济补偿的计算基数有特殊规定（如上海、广东等地明确提成、奖金应计入平均工资），需结合当地司法实践判断。例如，广东省高级人民法院《关于审理劳动争议案件疑难问题的解答》中明确，经济补偿的月工资包括“提成、奖金、津贴、补贴等货币性收入”。

建议行动

1. 收集证据：整理劳动合同、工资条、提成发放记录、公司撤店通知等材料，证明提成属于工资组成部分及实际发放情况。
   
2. 协商或投诉：与公司协商经济补偿金额，若协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
   
3. 计算示例：假设您离职前12个月平均工资为1万元（其中保底5000元，提成5000元），工作6年，则经济补偿应为6万元（1万×6）；若公司违法解除，则赔偿金为12万元（2万×6）。

如有进一步细节（如提成发放规则、公司撤店程序等），可提供更多信息以便更精准分析。