对于公司为工伤员工垫付的费用，劳动者在仲裁中未提及，是否在劳动仲裁中要反诉的问题，需要具体分析情况。
若公司希望追回垫付费用：
- 如果公司在劳动仲裁中希望追回为工伤员工垫付的费用，且劳动者在仲裁申请中并未提及这部分费用，那么公司可以在仲裁过程中提出反诉请求，要求劳动者返还垫付的费用。
- 公司在提出反诉时，需要提供充分的证据来证明垫付费用的事实和金额，如支付凭证、医疗费用清单等。
若公司不追求追回垫付费用：
- 如果公司并不打算追回垫付的费用，或者认为这部分费用是公司作为雇主应承担的责任，那么公司在劳动仲裁中无需提出反诉。
- 在这种情况下，公司可以放弃对垫付费用的追偿权，而专注于处理劳动仲裁中的其他争议点。
考虑劳动仲裁的效率和公正性：
- 在劳动仲裁中，提出反诉可能会增加仲裁的复杂性和时间成本。因此，公司在决定是否提出反诉时，需要权衡仲裁的效率和公正性。
- 如果垫付费用金额不大，或者公司认为提出反诉可能对双方关系造成进一步恶化，那么公司可能会选择不提出反诉。
综上所述，公司在劳动仲裁中是否要反诉追回为工伤员工垫付的费用，取决于公司的具体意愿、垫付费用的性质和金额，以及劳动仲裁的效率和公正性等因素。如果公司有此需求，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。