结论：做工伤认证时若与老板闹翻，是否继续去公司上班需根据具体情况决定，包括工伤认定结果、双方关系、工作性质及个人意愿等因素。以下从不同角度为你详细分析：
一、从工伤认定和赔偿的角度
- 工伤认定流程不受影响：工伤认定是由社会保险行政部门负责，依据《工伤保险条例》等相关法律法规进行。只要你符合工伤认定的条件，如工作时间、工作场所内因工作原因受到事故伤害等，即使与老板闹翻，也不影响工伤认定的申请和结果。因此，从工伤认定的角度来看，是否继续上班并不直接影响你的权益。
- 赔偿问题需关注：如果工伤认定成功，你将有权获得相应的工伤保险待遇，包括医疗费用、停工留薪期工资、伤残补助金等。这些待遇的支付通常与公司的配合程度有关。如果与老板关系紧张，可能会影响到赔偿的及时性和顺利性。但即便如此，你仍可以通过法律途径维护自己的权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼。
二、从工作关系的角度
- 继续上班的可能性：
- 如果双方关系尚可修复：尽管目前与老板闹翻，但如果双方能够冷静沟通，解决分歧，那么继续上班可能是一个不错的选择。毕竟，工作不仅关乎收入，还涉及职业发展、社交关系等多个方面。
- 如果工作性质允许：如果你的工作性质相对独立，不需要频繁与老板或同事互动，那么即使关系紧张，也可能继续胜任工作。
- 不再上班的考虑：
- 如果关系无法修复：如果与老板的关系已经恶化到无法修复的地步，继续上班可能会让你感到压抑和不适，甚至影响到工作效率和身心健康。在这种情况下，考虑离职可能是一个更明智的选择。
- 如果找到更好的机会：如果你已经找到了更好的工作机会，那么离职也是一个合理的选择。毕竟，职业发展是个人成长的重要部分，不应该因为一时的纠纷而耽误。
三、从法律风险的角度
- 离职需谨慎：如果你决定离职，需要注意离职的程序和方式。根据《劳动合同法》的规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。在试用期内，劳动者提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。如果你未按照法定程序离职，可能会面临一些法律风险，如被公司追究违约责任等。
- 保留证据：无论你选择继续上班还是离职，都需要保留好与工伤认定、赔偿以及工作关系相关的证据。这些证据在未来的法律纠纷中可能会起到关键作用。
四、具体建议
- 冷静沟通：首先尝试与老板进行冷静、理性的沟通，解决分歧和矛盾。如果可能的话，可以寻求第三方（如人力资源部门、工会等）的协助。
- 咨询专业意见：在做出决定前，可以咨询我这样的专业律师或劳动仲裁机构的意见，了解自己的权益和可能的法律风险。
- 做好准备：如果你决定离职，需要提前做好准备，包括寻找新的工作机会、整理个人物品、办理离职手续等。
最后，做工伤认证时与老板闹翻并不意味着你必须立即离职或继续忍受不愉快的工作环境。你需要根据自己的实际情况和需求做出明智的选择。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。