结论：试用期3个月，实际入职49天（不足两个月）时用人单位解除劳动关系是否违法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若用人单位解除劳动关系的理由合法
   根据《劳动合同法》第三十九条，劳动者在试用期间被证明不符合录用条件的，用人单位可以解除劳动合同。关键点：

   • 用人单位需明确录用条件（如岗位职责、技能要求等），并在入职时告知劳动者；
     
   • 解除需基于客观证据（如考核结果、工作失误记录等），而非主观评价；
     
   • 解除程序需合法（如提前通知、听取劳动者申辩等）。
     若满足上述条件，即使试用期未满3个月，用人单位解除劳动关系也不违法。

2. 若用人单位解除劳动关系的理由不合法
   若用人单位无法证明劳动者不符合录用条件，或以其他非法理由（如性别歧视、报复等）解除劳动关系，则构成违法解除。法律后果：

   • 劳动者可要求继续履行劳动合同；
     
   • 或要求用人单位支付赔偿金，计算公式为：
     [ \text{赔偿金} = \text{月工资} \times \text{工作年限} \times 2 ]
     （工作年限不足6个月的按0.5个月计算，此处为0.5个月，故赔偿金为1个月工资）。

3. 试用期约定是否合法的影响

   • 根据《劳动合同法》第十九条，劳动合同期限3个月以上不满1年的，试用期不得超过1个月；1年以上不满3年的，试用期不得超过2个月。
     
   • 若试用期约定本身违法（如合同期限1年却约定3个月试用期），则试用期条款无效，劳动者实际入职49天时已视为正式员工，用人单位解除需按正式员工标准赔偿（即赔偿金为2个月工资）。

建议：

• 若您认为用人单位解除违法，可收集证据（如录用条件通知、考核记录、解除通知等）申请劳动仲裁；
  
• 若用人单位解除合法，但您对考核结果有异议，可要求用人单位提供证据并申辩；
  
• 无论何种情况，均建议先与用人单位协商，协商不成再通过法律途径解决。
  

如有进一步疑问或需具体指导，可直接向我咨询。