结论：在腿受伤无法上班且店长不同意离职的情况下，如果直接离职，店长一般不能随意扣工资，但具体情况需根据劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。
分析如下：
劳动合同与规章制度：
- 首先，要查看你与店长（或公司）签订的劳动合同中是否有关于离职、工资支付以及因伤离职的具体条款。如果合同中有明确规定，那么应按照合同执行。
- 其次，要了解公司的规章制度。有些公司可能有规定，员工在特定情况下（如因伤无法工作）离职时，工资的处理方式。如果公司规章制度中有相关规定，且这些规定不违反法律法规，那么也应按照规章制度执行。
法律法规：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，员工因伤无法工作，且经过劳动能力鉴定委员会鉴定为工伤的，有权享受工伤保险待遇，包括医疗费、停工留薪期工资等。如果店长不同意你离职且你确实因伤无法工作，你可以先申请工伤认定，并享受相应的工伤保险待遇。
- 即使未被认定为工伤，员工因伤无法工作期间，公司也应按照劳动合同或公司规章制度支付相应的工资或生活费。如果公司无正当理由扣减工资，你可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
直接离职的法律后果：
- 如果你在没有与店长达成一致的情况下直接离职，这可能构成违约或违反公司规章制度。然而，这并不意味着店长可以随意扣减你的工资。店长扣减工资必须有合法的依据，如劳动合同中的约定、公司规章制度的规定或法律法规的允许。
- 如果店长无正当理由扣减你的工资，你可以通过法律途径维护自己的权益，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼。
建议：
- 在决定离职前，先与店长进行沟通，说明你的伤情和无法工作的情况，尝试达成一致意见。
- 如果店长不同意你离职或扣减你的工资，你可以先了解公司的规章制度和劳动合同中的相关条款，然后咨询专业律师（即我，周静律师，专注于劳动纠纷领域）的意见。
- 如果确实需要离职且担心工资问题，你可以在离职前与公司协商好工资支付事宜，并保留好相关证据（如工资条、劳动合同、沟通记录等），以备不时之需。
额外提醒：
- 在处理此类纠纷时，保持冷静和理性至关重要。避免与店长或公司发生不必要的冲突，尽量通过协商或法律途径解决问题。
- 如果你的伤情较为严重或复杂，建议及时咨询医生或专业医疗机构，以确保你的健康得到妥善照顾。同时，也可以咨询我，了解如何更好地维护自己的劳动权益。