结论：总包以签订协议形式认可农民工工资后，是否需要仲裁取决于协议的具体内容、履行情况以及双方是否存在争议。以下从不同角度进行分析：

1. 协议内容明确且已履行：

   • 如果总包与农民工签订的协议中明确约定了工资的数额、支付方式、支付时间等关键条款，并且总包已经按照协议约定全额支付了工资，那么双方之间就不存在工资争议。
   • 在这种情况下，农民工无需再通过仲裁来维护自己的权益，因为协议已经得到了履行，仲裁的前提（即存在争议）已经不存在。

2. 协议内容明确但未履行：

   • 如果协议内容明确，但总包未按照协议约定支付工资，那么农民工有权依据协议向总包主张工资。
   • 在此情况下，农民工可以选择与总包协商解决，如果协商不成，则可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。仲裁机构将依据协议内容以及相关法律法规，对总包是否应支付工资以及支付多少工资进行裁决。

3. 协议内容不明确或存在争议：

   • 如果协议内容模糊不清，或者双方对协议的解释存在分歧，导致无法确定工资的具体数额或支付方式等关键条款，那么双方之间就存在工资争议。
   • 在这种情况下，农民工需要通过劳动仲裁来明确双方的权利义务关系。仲裁机构将依据相关法律法规以及双方提供的证据，对争议事项进行裁决。

4. 协议存在违法情形：

   • 如果协议中存在违反法律法规的条款，如低于最低工资标准、不支付加班费等，那么这些条款是无效的。
   • 农民工有权依据法律法规向总包主张合法的工资权益，如果总包拒绝支付，农民工可以通过劳动仲裁来维护自己的权益。仲裁机构将依据法律法规，对总包是否应支付合法工资以及支付多少工资进行裁决。

法律建议：

• 在签订协议时，农民工应确保协议内容明确、具体，并涵盖工资数额、支付方式、支付时间等关键条款。
• 如果总包未按照协议约定支付工资，农民工应及时与总包协商解决，并保留好相关证据（如协议、工资条、考勤记录等）。
• 如果协商不成，农民工可以向当地劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果农民工选择仲裁并胜诉，总包将被裁决支付拖欠的工资以及可能的滞纳金或赔偿金。
• 如果总包拒不履行仲裁裁决，农民工可以向人民法院申请强制执行。