当您发现劳动合同上的用人单位与实际发生争议的单位不一致，并决定申请劳动仲裁时，可以按照以下详细步骤来操作，以确保您的权益得到有效维护：
一、明确仲裁受理范围
首先，您需要确认您的争议是否属于劳动仲裁的受理范围。劳动仲裁主要处理与劳动关系相关的争议，包括但不限于劳动合同的订立、履行、变更、解除和终止，以及劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等方面的争议。如果您的争议属于这些范畴，那么您就可以考虑申请劳动仲裁。
二、确定管辖的仲裁委员会
接下来，您需要确定应该向哪个劳动争议仲裁委员会提出申请。一般来说，您可以选择向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会提出申请。如果双方分别向不同地点的仲裁委员会申请，那么通常由劳动合同履行地的仲裁委员会管辖。在您的情况下，尽管劳动合同上的用人单位与实际单位不一致，但您仍应根据实际劳动关系发生地或实际用人单位所在地来确定管辖的仲裁委员会。
三、全面收集证据材料
证据是仲裁成功的关键。您需要收集两类证据：一是证明劳动关系的证据，如实际工作证、考勤记录、工资发放记录（可能涉及实际用人单位的银行转账记录）、社保缴纳记录（如果实际用人单位为您缴纳了社保）以及同事证言等；二是支持您仲裁请求的证据，例如如果您追讨工资，需要提供工资条和银行流水；如果是加班工资争议，则需要加班审批单和打卡记录等。这些证据应尽可能真实、完整，并能够清晰地证明您的主张。
四、准备并提交仲裁申请材料
在准备好证据后，您需要准备仲裁申请材料。这包括：
五、正式提交申请
将准备好的材料提交至选定的仲裁委员会。您可以选择现场提交，或者根据当地要求通过邮寄、网上平台等方式提交。仲裁委员会将在五日内决定是否受理，并通知您。
六、参与仲裁庭审
如果仲裁委受理了您的申请，他们会在五日内将申请书副本送达被申请人（即实际用人单位），被申请人有十日答辩期。开庭前五日，仲裁委会书面通知双方当事人开庭日期和地点。在庭审过程中，您需要清晰阐述您的仲裁请求和事实理由，充分举证，并与被申请人围绕争议焦点进行辩论。
七、等待并接收仲裁裁决
仲裁庭通常在受理申请之日起四十五日内作出裁决，复杂案件可延期十五日。裁决书自作出之日起发生法律效力。如果您对裁决不服，可以在收到裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。如果公司拒不执行裁决，您可以向法院申请强制执行。
八、注意时效期间
最后，您需要注意劳动仲裁申请有一年的时效期间，从您知道或应当知道您的权利被侵害之日起计算。因此，及时行动至关重要，不要错过申请仲裁的时机。
综上所述，尽管劳动合同上的用人单位与实际发生争议的单位不一致，但您仍然可以通过遵循上述步骤来申请劳动仲裁，并维护自己的合法权益。希望这些信息能对您有所帮助。