结论：在化工园区厕所抽烟被按生产区抽烟辞退是否合法，需根据具体情况判断，包括公司规章制度的内容、制定程序、是否公示以及员工行为是否严重违反等。以下从不同角度进行分析：
一、公司规章制度的角度
规章制度内容合法性：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。公司规章制度中若明确规定“在生产区（包括厕所等附属区域）抽烟属于严重违反规章制度的行为，公司有权解除劳动合同”，且该规定不违反法律法规的强制性规定，则该内容本身是合法的。
规章制度制定程序：
- 规章制度需经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。若公司规章制度未经上述程序制定，可能因程序违法而被认定无效。
规章制度公示或告知：
- 公司规章制度需向劳动者公示或告知。若公司未将规章制度告知员工，员工可能主张其不知情，从而质疑公司依据该规章制度解除劳动合同的合法性。
二、员工行为的角度
员工行为是否严重违反规章制度：
- 即使公司规章制度合法且已公示，还需判断员工在化工园区厕所抽烟的行为是否构成“严重违反规章制度”。这通常需要根据规章制度的具体规定、员工行为的性质、情节以及可能造成的后果等因素综合判断。
- 化工园区通常属于易燃易爆场所，抽烟可能引发火灾或爆炸等严重后果，因此公司可能将此类行为视为严重违反规章制度。
员工是否知晓并同意规章制度：
- 若员工在入职时已签署确认书，表明其知晓并同意公司规章制度，且规章制度中明确规定了抽烟的处罚措施，则员工在厕所抽烟被辞退的合法性更高。
三、法律后果的角度
合法解除劳动合同：
- 若公司规章制度合法、已公示且员工行为严重违反，则公司有权依据《劳动合同法》第三十九条第二项“严重违反用人单位的规章制度的”解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
违法解除劳动合同：
- 若公司规章制度存在程序违法、未公示或员工行为不构成严重违反等情形，则公司解除劳动合同的行为可能被认定为违法。此时，员工有权要求公司支付赔偿金（即经济补偿的两倍）。
建议
- 对于公司：应确保规章制度的合法性、程序性和公示性，明确抽烟等违规行为的处罚措施，并在员工入职时进行充分告知和培训。
- 对于员工：应仔细阅读并了解公司规章制度，遵守相关规定，避免违规行为。若对公司解除劳动合同的决定有异议，可依法申请劳动仲裁或提起诉讼。
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