结论：公司因员工在厕所抽烟而罚款500元是否合法，需根据具体情况判断，主要看公司规章制度是否合法有效以及罚款是否超出合理范围。

分析：

1. 公司规章制度合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
   • 如果公司规章制度中明确规定了禁止在厕所抽烟，并且该规定经过了上述民主程序制定，且内容不违反法律、行政法规及政策规定，那么该规章制度是合法的。

2. 罚款的合理性：

   • 即便公司规章制度合法，罚款的数额也需合理。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 在没有造成实际经济损失的情况下，公司对员工进行罚款可能缺乏法律依据。如果公司仅以员工违反规章制度为由进行罚款，且罚款数额过高（如500元），可能被视为不合理。

3. 具体案例判断：

   • 如果公司规章制度合法，且罚款数额在合理范围内（如未超过员工当月工资的20%，且扣除后工资不低于最低工资标准），那么公司罚款500元可能是合法的。
   • 如果公司规章制度未经过民主程序制定，或者罚款数额过高，那么公司罚款500元可能是不合法的。

建议：

• 对于员工：如果认为公司罚款不合理，可以先与公司沟通协商，要求公司说明罚款的依据和合理性。如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 对于公司：在制定规章制度时，应确保规章制度合法有效，并经过民主程序制定。在罚款时，应确保罚款数额合理，且不超过法律规定的限额。

后续行动：

• 如果你或你的同事遇到了类似情况，且对罚款的合法性有疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律建议。