公司效益不好时，工时的计算方式主要取决于公司的具体规定、劳动合同的约定以及相关法律法规的要求，以下分情况说明：
标准工时制下的工时计算：
- 在标准工时制下，员工每日工作时间通常不超过8小时，每周工作时间不超过40小时。公司效益不好，并不直接影响工时的计算方式，除非公司决定缩短工作时间或调整工作安排。
- 如果公司因效益不好而决定缩短工作时间，应与员工协商一致，并确保缩短后的工作时间仍符合法律法规的要求。同时，公司应按照实际工作时间支付员工工资，不得因缩短工时而降低员工的工资水平（除非双方另有约定）。
综合计算工时制或不定时工时制下的工时计算：
- 如果公司实行综合计算工时制或不定时工时制，工时的计算方式将更加灵活。综合计算工时制通常是以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间，但其平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。
- 在不定时工时制下，员工的工作时间不受固定时间限制，而是根据工作需要灵活安排。因此，在公司效益不好的情况下，公司可能根据实际需要调整员工的工作时间，但同样应确保员工的合法权益不受侵害。
公司效益不好时的特殊工时安排：
- 如果公司因效益不好而面临经营困难，可能会考虑采取特殊工时安排，如轮休、调休、缩短工时等。这些安排应基于与员工的协商一致，并符合相关法律法规的要求。
- 公司应确保特殊工时安排不会对员工的身体健康和合法权益造成不利影响。例如，缩短工时后，公司应确保员工的工资水平不低于当地最低工资标准；轮休或调休时，应确保员工有足够的休息时间。
法律法规的遵循：
- 无论公司采取何种工时计算方式，都必须严格遵守国家关于工作时间和休息休假的法律法规。例如，《劳动法》规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时（后调整为40小时），并应保证劳动者每周至少休息1日。
- 如果公司违反相关法律法规，员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动争议仲裁，维护自己的合法权益。
建议：公司效益不好时，工时的计算方式应基于与员工的协商一致，并确保符合相关法律法规的要求。如果公司需要调整工时安排，应提前与员工进行沟通，并明确调整后的工时计算方式和工资支付标准。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。