结论：员工在非工作时间出车祸住院治疗期间，单位停发工资的行为是否合法，需根据具体情况判断。若员工因交通事故被认定为工伤，则单位停发工资不合法；若未被认定为工伤，则单位停发工资可能合法，但需考虑其他因素。
详细分析：
若员工因交通事故被认定为工伤：
- 法律依据：根据《工伤保险条例》的相关规定，员工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。一旦被认定为工伤，员工有权享受工伤保险待遇，包括停工留薪期内的工资福利。
- 工资支付：在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，即使员工因工伤住院治疗，单位也应继续支付其工资，不得停发。
- 法律后果：如果单位在员工被认定为工伤后停发工资，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求单位支付停工留薪期内的工资，并可能获得相应的经济补偿。
若员工因交通事故未被认定为工伤：
- 法律依据：如果员工因个人原因（如违反交通规则、酒驾等）导致交通事故，且未被认定为工伤，则单位停发工资可能合法，但需考虑劳动合同和单位规章制度的规定。
- 劳动合同与规章制度：根据《劳动合同法》和单位的相关规章制度，如果员工因个人原因无法工作，单位有权根据合同或规章制度停发工资或调整薪酬。但这一行为必须合法合规，且不得违反劳动法的相关规定。
- 特殊情况：即使员工未被认定为工伤，如果其因交通事故导致暂时无法工作，且单位同意其请假治疗，单位也应根据劳动合同或规章制度的规定，支付一定的病假工资或生活费。如果单位完全停发工资，可能涉及违法解除劳动合同或未支付劳动报酬的问题，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
建议与行动：
- 员工方面：如果员工因交通事故住院治疗，首先应尽快了解自己是否被认定为工伤。如果被认定为工伤，应要求单位继续支付工资；如果未被认定，应查看劳动合同和单位规章制度，了解自己的权益和义务。如果单位停发工资且无法协商解决，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 单位方面：单位在处理员工因交通事故住院治疗期间的工资问题时，应严格遵守相关法律法规和劳动合同的规定。如果员工被认定为工伤，应继续支付工资；如果未被认定，也应根据合同或规章制度的规定，合理支付病假工资或生活费，避免引发劳动争议。
进一步思考：
- 工伤认定的重要性：工伤认定是员工享受工伤保险待遇的前提。因此，员工在发生交通事故后，应及时向单位报告，并尽快申请工伤认定。单位也应积极配合员工进行工伤认定申请，确保员工的合法权益得到保障。
- 劳动合同与规章制度的完善：单位应制定完善的劳动合同和规章制度，明确员工在因个人原因无法工作时的薪酬支付规定。这有助于减少劳动争议的发生，维护单位和员工的合法权益。
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