结论前置：公司要求与劳动合同约定的标准工时制不符时，员工可按以下步骤处理：1. 核查公司制度合法性；2. 与公司协商调整；3. 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。以下为具体分析：

1. 核查公司弹性工作制的合法性

根据《劳动法》第三十六条，标准工时制要求每日工作时间不超过8小时、平均每周不超过44小时，且需保证劳动者每周至少休息1日。若公司要求弹性工作制，需满足以下条件之一：

• 法定特殊工时制：经劳动行政部门审批，公司可对特定岗位（如高管、外勤、研发等）实行不定时工作制或综合计算工时制，但需在劳动合同中明确约定或补充协议说明。
• 双方协商一致：若未经审批，公司单方面要求弹性工作制，需与员工书面协商一致并变更劳动合同条款。若未协商或员工拒绝，公司无权强制执行。

行动建议：要求公司出示弹性工作制的审批文件或书面协商记录。若无法提供，则公司行为涉嫌违法。

2. 与公司协商调整

若公司未履行法定程序，员工可主动沟通，明确拒绝单方面变更工时制度，并要求公司：

• 继续履行劳动合同约定的标准工时制；
• 若需变更，需重新签订书面协议并明确加班补偿、调休等条款。

注意：协商过程中保留书面沟通记录（如邮件、微信聊天记录），避免口头约定。

3. 向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁

若公司拒绝协商或强行实施弹性工作制，员工可采取以下措施：

• 投诉：向当地劳动监察大队举报公司违法行为（如未审批特殊工时制、未支付加班费等），要求责令整改。
• 仲裁：以公司“未按照劳动合同约定提供劳动条件”为由，申请劳动仲裁，要求解除劳动合同并主张经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。

证据准备：劳动合同、公司要求弹性工作制的通知、考勤记录、工资条等，证明公司单方面变更工时制度且未支付相应补偿。

4. 特殊情形：弹性工作制的合理性边界

即使公司经审批实行弹性工作制，也需遵守以下限制：

• 每日工作时间上限：仍需保证劳动者每日工作时间不超过法定上限（如8小时），超出部分需支付加班费或安排调休。
• 健康保障：不得以弹性工作制为由剥夺劳动者休息权或强制连续工作，否则可能构成“强迫劳动”。

示例：若公司要求员工“随时待命”但未明确工作时间，导致实际每日工作超12小时，员工可主张加班费或以“未提供劳动保护条件”为由解除合同。

总结：公司无权单方面将标准工时制变更为弹性工作制，员工可通过协商、投诉或仲裁维护权益。若需进一步分析具体案情或协助准备证据，可直接向我提问。