结论：员工未提供请假单且未上班，后续来上班时，公司是否可以警告需根据具体情况判断，包括公司规章制度、员工未上班的原因及情节严重程度等。

分析如下：

1. 公司规章制度的角度：

   • 如果公司有明确的规章制度，规定了员工请假需提交请假单，且未提交请假单且未上班属于违纪行为，那么公司有权根据规章制度对员工进行相应的纪律处分，包括警告。
   • 规章制度应当经过民主程序制定，且已向员工公示或告知，否则可能因程序瑕疵而无效。

2. 员工未上班的原因及情节严重程度：

   • 如果员工未上班是因为突发疾病、家庭紧急情况等不可抗力或合理原因，且事后能够提供合理证明，那么公司可能不宜直接给予警告，而应考虑员工的实际情况，采取更为人性化的处理方式。
   • 如果员工未上班且无正当理由，且情节严重（如连续多日未上班、未与公司沟通等），那么公司给予警告是合理的，甚至可能根据规章制度给予更严厉的处分。

3. 法律原则的角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位有权制定规章制度，并依据规章制度对员工进行管理。但规章制度的内容必须合法、合理，且不得侵犯员工的合法权益。
   • 公司在对员工进行纪律处分时，应当遵循公平、公正、公开的原则，确保处分决定的合法性和合理性。

建议：

• 公司方面：在给予员工警告前，应先核实员工未上班的具体原因，并查看公司规章制度中是否有相关规定。如果规章制度中有明确规定，且员工的行为确实违反了规定，那么公司可以依据规章制度给予警告。同时，公司应当确保规章制度的合法性和合理性，并遵循公平、公正、公开的原则进行处理。
• 员工方面：如果员工因特殊原因未能及时提交请假单，应及时与公司沟通并说明情况，提供合理证明。如果公司因此给予警告，员工可以与公司协商解决，或者根据公司的规章制度提出申诉。

可能后果：

• 如果公司未经核实或未依据规章制度就给予员工警告，可能引发劳动争议，员工可能向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
• 如果员工的行为确实违反了公司规章制度，且公司依法给予了警告，那么员工应当接受处分，并改正自己的行为。

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