结论：公司员工请假未获同意直接离开并声称只能线上交接，一般情况下公司不能直接报警，但具体还需结合员工行为性质及公司规章制度等综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
从报警的合法性角度
报警是公民或单位在面临紧急情况、违法行为等时，向公安机关寻求帮助的一种方式。通常来说，员工请假未获批准直接离开且表示只能线上交接，这种行为本身并不直接构成刑事犯罪或需要公安机关立即介入处理的紧急治安事件。所以，一般情况下公司不能仅因员工此行为就直接报警。
不过，如果员工在离开过程中存在其他违法行为，例如破坏公司财物、盗窃公司机密资料等，那么公司可以就这些违法行为向公安机关报案，公安机关会依据相关法律法规进行调查处理。
从公司规章制度角度
公司通常会有自己的规章制度来规范员工的请假、离职等行为。如果公司的规章制度中明确规定，员工请假必须经过特定流程审批，未经批准擅自离岗属于严重违反规章制度的行为，公司可以依据规章制度对员工进行相应的处理，比如警告、扣发工资、解除劳动合同等。
示例：某公司规章制度规定，员工请假需提前三天提交书面申请，经部门主管和人力资源部门批准后方可离岗。若员工未按规定请假擅自离开，公司有权扣除其当月绩效奖金。在这种情况下，公司应按照规章制度流程处理，而不是直接报警。
从劳动法律角度
根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，员工有义务遵守公司的合法规章制度，同时公司也有义务保障员工的合法权益。如果员工请假未获批准直接离开，公司不能随意采取极端措施，如非法限制员工人身自由等。
如果员工的行为给公司造成了实际损失，公司可以依据法律规定和劳动合同的约定，要求员工承担赔偿责任。但这也需要通过合法的途径，如劳动仲裁或民事诉讼等来解决，而不是直接报警。
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