针对您提出的“公司撤店怀孕员工怎么处理”的问题，这涉及到劳动法中关于女职工在孕期、产期、哺乳期的特殊保护规定。以下是我为您提供的详细解答：
首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位是不得以“不能胜任工作”等为由解除劳动合同的。这是法律对女职工的特殊保护，旨在保障她们在这一特殊时期的合法权益。
针对公司撤店这一具体情况，如果公司因为撤店而需要与员工解除劳动合同，那么对于处于孕期、产期、哺乳期的女职工，公司应当遵循以下原则：
继续履行劳动合同：如果您希望继续在公司工作，且公司撤店后仍有能力继续履行劳动合同（例如，公司有其他业务或分支机构可以接收您），那么公司应当继续履行与您的劳动合同。
支付赔偿金：如果您不想继续在公司工作，或者由于公司撤店导致客观上无法继续履行劳动合同，那么您可以向公司主张赔偿金。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条和第八十七条的规定，赔偿金的标准是经济补偿标准的二倍。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
例如，如果您在公司工作了5年8个月，解除劳动关系前12个月的平均工资是6000元，那么您可以主张的赔偿金为72000元（6000元/月×6个月×2倍）。
协商与调解：在处理此类问题时，建议您首先与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如果协商不成，您可以向当地的劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
法律途径：如果通过协商和调解仍无法解决问题，您可以依法向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总之，公司撤店时对于处于孕期、产期、哺乳期的女职工，应当遵循法律的规定，不得随意解除劳动合同。如果确实需要解除，应当依法支付赔偿金，并尊重女职工的选择权。希望这些解答能够帮助您更好地理解自己的权益和应对策略。