两家公司合并后辞退员工，赔偿责任应由合并后存续或新设的公司承担。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律背景与原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条：“用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行。” 这意味着，当两家公司合并时，原劳动合同对合并后的公司仍然具有约束力，合并后的公司需要继续履行原劳动合同中的义务，包括支付工资、提供劳动条件等。同时，如果合并后的公司决定辞退员工，那么赔偿责任也应由合并后的公司承担。
二、合并类型与赔偿责任
吸收合并：
- 在吸收合并中，一家公司吸收另一家公司，被吸收的公司解散。此时，吸收公司承继被吸收公司的权利和义务，包括与员工的劳动合同关系。
- 如果吸收公司决定辞退员工，那么赔偿责任应由吸收公司承担。
新设合并：
- 在新设合并中，两家或多家公司合并设立一家新公司，原公司均解散。此时，新公司承继原公司的权利和义务。
- 如果新公司决定辞退员工，那么赔偿责任应由新公司承担。
三、赔偿标准与计算
如果合并后的公司决定辞退员工，且不符合法定无过失性辞退或经济性裁员的情形，那么公司需要支付经济补偿金。经济补偿金的计算标准如下：
- 经济补偿金计算：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：“经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。”
- 公式：经济补偿金 = 劳动者在本单位工作的年限 × 劳动者月工资
- 其中，月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
四、实际操作建议
审查合并协议：
- 在公司合并过程中，应仔细审查合并协议，明确合并后公司的权利和义务，包括与员工的劳动合同关系。
与员工协商：
- 如果合并后的公司决定辞退员工，应与员工进行充分协商，确保辞退过程合法、合规，并尽量减少对员工的影响。
准备赔偿方案：
- 根据经济补偿金的计算标准，准备赔偿方案，确保赔偿金额准确、合理。
遵守法律程序：
- 在辞退员工过程中，应遵守相关法律程序，如提前通知、支付经济补偿金等，以避免法律纠纷。
总结来看，两家公司合并后辞退员工，赔偿责任应由合并后存续或新设的公司承担。在处理此类问题时，应遵守相关法律法规，确保辞退过程合法、合规，并尽量减少对员工的影响。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。