公司合并进行裁员时，赔偿员工的方式主要遵循法律规定的经济补偿标准。以下是详细的解答：
一、经济补偿的标准
按工作年限计算：
- 员工在本单位每工作满一年，公司需支付一个月工资作为经济补偿。
- 工作六个月以上但不满一年的，按一年计算，即支付一个月工资。
- 工作不满六个月的，公司需支付半个月工资作为经济补偿。
月工资标准的确定：
- 员工的月工资是指其离职前十二个月的平均工资。
- 如果员工的月工资高于所在直辖市或设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，但支付年限最高不超过十二年。
二、特殊情况下的赔偿
公司未依法支付经济补偿：
- 如果公司未按时支付经济补偿，员工可以向劳动行政部门投诉。
- 劳动行政部门会责令公司限期支付；逾期不支付的，公司将需按应付金额的百分之五十以上百分之一百以下的标准向员工加付赔偿金。
单位裁员存在违法情形：
- 如果单位在裁员过程中存在违法情形，如未提前三十日向工会或全体职工说明情况，或裁减人员方案未经向劳动行政部门报告等，员工有权要求单位继续履行劳动合同或支付赔偿金。
- 赔偿金的标准为经济补偿标准的二倍。
三、公司吸收合并时的员工赔偿
在公司吸收合并的情况下，若员工的劳动合同由合并后的公司承继，一般无需进行赔偿。但如果合并导致劳动合同无法继续履行，如工作岗位、工作内容等发生重大变化且员工不同意变更，用人单位解除劳动合同的，同样需按照上述经济补偿的标准支付赔偿。
四、建议与总结
- 在面临公司合并裁员时，员工应首先了解自己的工作年限和月工资标准，以便准确计算应得的经济补偿。
- 如果公司未依法支付经济补偿或存在其他违法情形，员工应及时向劳动行政部门投诉并寻求法律援助。
- 同时，员工也应关注公司合并后的劳动合同承继情况，确保自己的合法权益得到保障。
综上所述，公司合并进行裁员时，赔偿员工的方式主要依据法律规定的经济补偿标准，并需考虑特殊情况下的赔偿以及公司吸收合并时的员工赔偿问题。员工应了解自己的权益并依法维护。