公司因门禁时间扣工资的行为，在大多数情况下是不合理的。下面我将从法律角度和实际操作层面为您详细解析：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 同时，《工资支付暂行规定》第十六条也明确指出，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但门禁时间并不直接等同于给用人单位造成经济损失，因此不能作为扣工资的理由。
实际操作层面：
- 门禁时间通常是公司为了管理员工出入、维护公司秩序而设定的，它并不直接关联到员工的工作表现或工作成果。
- 如果公司因门禁时间扣工资，这实际上是对员工的一种惩罚措施，而这种惩罚措施并没有明确的法律依据。
- 此外，如果公司想要对员工进行惩罚，也应该通过合法的程序进行，比如依据公司规章制度进行处罚，并且这些规章制度必须是在员工入职时就已经明确告知并经过员工同意的。
建议：
- 如果您遭遇了公司因门禁时间扣工资的情况，建议您首先与公司进行沟通，了解扣工资的具体原因和依据。
- 如果公司无法提供合理的解释或依据，您可以向当地劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。
- 同时，也建议您在入职时仔细阅读公司的规章制度，确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，公司因门禁时间扣工资的行为在大多数情况下是不合理的，也没有法律依据。如果您遇到了这种情况，可以积极与公司沟通并寻求解决方案，必要时可以向劳动监察部门投诉。