漏打卡但上班了被扣工资，其合理性取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：
一. 公司规章制度与劳动合同的重要性
- 公司规章制度：根据《劳动法》第四条，用人单位应当依法建立和完善规章制度，保障劳动者享有劳动权利和履行劳动义务。因此，公司有权制定包括考勤管理在内的规章制度，并要求员工遵守。
- 劳动合同约定：根据《劳动法》第十六条，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了漏打卡的处理方式（如扣工资），且该规定不违反法律法规，那么公司按照约定执行是合理的。
二. 漏打卡被扣工资的合理性分析
- 若公司规章制度或劳动合同有明确规定：在这种情况下，员工漏打卡被扣工资是符合公司规定和劳动合同约定的，因此是合理的。员工应当遵守公司的规章制度和劳动合同的约定，避免漏打卡等违规行为。
- 若公司规章制度或劳动合同无明确规定：如果公司没有明确规定漏打卡的处理方式，或者劳动合同中没有相关约定，那么公司单方面扣工资可能构成对员工权益的侵犯。在这种情况下，员工可以与公司进行沟通，要求公司说明扣工资的依据，并寻求合理的解决方案。
三. 建议与总结
- 建议：对于员工来说，应当了解并遵守公司的规章制度和劳动合同的约定，避免因为漏打卡等小失误而遭受不必要的损失。同时，如果对公司扣工资的行为有异议，应当及时与公司进行沟通，寻求合理的解决方案。
- 总结：漏打卡但上班了被扣工资是否合理，关键在于公司规章制度和劳动合同中是否有相关规定。如果有明确规定且不违反法律法规，那么扣工资是合理的；如果没有明确规定或约定，员工有权要求公司说明扣工资的依据，并寻求合理的解决方案。
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