结论前置：在大多数情况下，未经合理程序制定规章制度或未造成实际损失的情况下，漏打卡扣50元工资是不合法的。劳动者有权维护自己的合法权益，而用人单位应依法依规处理考勤问题。
一、法律依据与原则
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
这两部法律为劳动者提供了基本的薪资保障，任何扣减工资的行为都必须有明确的法律依据和合理的理由。
二、合法扣减工资的情形
尽管一般情况下漏打卡扣工资不合法，但在特定条件下，用人单位可以依据合法有效的规章制度扣减工资：
规章制度的合法性：
- 制定程序合法：规章制度需通过民主程序制定，如职工代表大会讨论、与工会协商等，确保反映多数职工意愿。
- 内容合理：关于漏打卡扣工资的规定应明确、合理，例如每月允许一定次数的漏打卡，且扣除比例不超过当月工资的合理范围（如每次漏打卡扣除不超过当月工资的1%，且扣除后工资不低于最低工资标准），并确保扣除后工资不低于最低工资标准。
- 公示与告知：规章制度需向全体劳动者公示或告知，确保其知晓相关规定。
造成实际损失：
- 若劳动者的漏打卡行为确实给用人单位造成了经济损失，如影响生产进度、工作交接等，用人单位可根据损失情况和劳动者过错程度，在合理范围内扣除工资作为赔偿。但需注意，扣除的工资数额应与实际损失相当，且不得违反最低工资标准等规定。
三、不合法的扣减情形
以下情况下，漏打卡扣工资属于违法行为：
无规章制度或规章制度无效：
- 若用人单位没有制定相关规章制度，或规章制度制定程序违法、内容不合理，则扣减工资缺乏合法依据。
扣除比例过高或低于最低工资标准：
- 扣除工资的比例过高，或扣除后工资低于当地最低工资标准，均侵犯了劳动者的合法权益。例如，若劳动者当月工资为3000元，因一次漏打卡就扣除50元虽看似不多，但如果规章制度中未明确规定且未经过民主程序制定，则这种扣减可能违法。更重要的是，如果多次漏打卡导致扣除总额过高，使得劳动者实际收入远低于最低工资标准，则肯定违法。
未造成实际损失：
- 即使劳动者漏打卡，但并未给用人单位造成任何实际损失，此时扣减工资也是不合法的。
四、劳动者维权途径
面对不合法的扣减工资行为，劳动者可以采取以下措施维护自己的权益：
与公司沟通协商：
- 首先尝试与公司进行友好沟通，了解扣减原因，并提出自己的异议。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉举报，请求其介入调查并处理。
申请劳动仲裁：
- 若投诉仍无法解决问题，劳动者可依法向劳动争议仲裁机关申请仲裁。
提起诉讼：
- 对仲裁裁决不服的，劳动者还可以向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
另外，《中华人民共和国劳动合同法》第三十条还规定，用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。
五、总结与建议
漏打卡扣工资是否合法取决于具体情况和用人单位的规章制度。用人单位在制定相关规章制度时，应确保程序的合法性、内容的合理性以及公示的充分性。同时，劳动者也应了解自己的权益和义务，在面对不合法的扣减工资行为时，积极采取措施维护自己的合法权益。双方应共同努力，构建和谐稳定的劳动关系。
如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。