公司因漏打卡扣钱是否合理，需分情况讨论：
若公司规章制度明确规定且合法合理：
- 规章制度合法性：根据《劳动合同法》第四条，公司有权制定规章制度，但需经过民主程序（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商）并公示或告知员工。若规章制度中明确规定了漏打卡的扣款标准，且该标准不违反法律法规的强制性规定（如不低于最低工资标准、不构成克扣工资等），则该规定具有法律效力。
- 扣款合理性：即使规章制度合法，扣款也需合理。例如，若员工因客观原因（如设备故障、网络问题）漏打卡，且能提供证据证明，公司不应扣款。若员工因自身原因漏打卡，扣款金额也应与漏打卡造成的实际损失相当，不能随意扣款。
若公司规章制度未明确规定或规定不合法：
- 未规定扣款：若公司规章制度中未明确规定漏打卡的扣款事项，公司无权单方面扣款。员工有权要求公司补发被扣的工资。
- 规定不合法：若规章制度中的扣款规定违反法律法规（如扣款后工资低于最低工资标准、扣款比例过高），则该规定无效。员工同样有权要求公司补发工资，并可向劳动监察部门投诉。
法律建议：
员工角度：
- 保留证据：如漏打卡记录、公司扣款通知、工资条等，以证明公司扣款的事实。
- 协商解决：先与公司协商，要求公司说明扣款依据并补发工资。
- 投诉或仲裁：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
公司角度：
- 完善规章制度：制定合法合理的考勤管理制度，明确漏打卡的扣款标准（如有）及程序。
- 公示告知：确保规章制度经过民主程序并公示或告知员工，避免因程序瑕疵导致规定无效。
- 灵活处理：对于因客观原因漏打卡的员工，应灵活处理，避免不必要的扣款引发劳动纠纷。
可能后果：
- 若公司违法扣款，可能面临劳动监察部门的处罚，如责令改正、罚款等。
- 员工可能因公司违法扣款而解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿金。
总结：公司因漏打卡扣钱是否合理，需根据规章制度是否合法合理、扣款是否合理等因素综合判断。员工在遇到此类情况时，应保留证据并积极维权；公司也应完善规章制度，避免违法扣款引发劳动纠纷。如有具体法律问题，可直接向我咨询。