公司打卡不规范扣工资是否合法，主要取决于公司规章制度是否合法、合理，并且是否得到了员工的明确同意，同时需确保扣款行为不违反国家法律法规。 以下是对此问题的详细分析：
合法且可能合理的情况
规章制度合法且完善
- 若公司制定了完善且合法的考勤制度，明确规定了打卡不规范（如漏打卡、迟到打卡等）的处理方式，包括扣工资的具体标准，且该制度已通过民主程序制定（如经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定），同时已向劳动者公示或告知，员工入职时已知悉并同意，那么在这种情况下，因打卡不规范扣工资可能被视为合法且合理。
- 示例：公司《考勤管理办法》规定，员工无正当理由漏打卡一次，将扣除当日工资的10%，该办法经职工代表大会讨论通过并公示，员工入职时签署知晓文件。
扣款在法律允许范围内
- 即使公司有合法的考勤制度，扣款也必须在法律允许的范围内。扣减后的工资不得低于当地最低工资标准，且扣除的部分通常不能超过劳动者当月工资的合理比例（具体比例可能因地区法律法规和公司规定而异，但一般建议在20%以内）。
不合法或不合理的情况
规章制度不合法或不合理
- 如果公司的考勤制度未经民主程序制定，或者内容违反法律法规强制性规定（如规定漏打卡一次就扣除当月全部工资），那么这种扣款行为就是不合法的。
- 示例：公司单方面规定，员工漏打卡一次将扣除当月全部奖金，这种规定显然不合理且可能违法。
存在正当理由未打卡
- 如果员工因合理客观原因未打卡（如打卡设备故障、因公外出等），且已及时向公司报备并提供相关证明，那么公司不应以此为由扣减工资。
- 示例：员工外出拜访客户期间，因打卡设备故障未能打卡，并及时向公司提供了外出工作证明和客户联系方式，公司应核实情况后不扣减工资。
劳动合同中无相关规定
- 如果劳动合同中未明确规定打卡与工资之间的关系，或公司未提前告知员工打卡不规范将扣工资，那么公司单方面以打卡不规范为由扣减工资可能构成违法行为。
建议与措施
- 公司层面：在制定和执行考勤制度时，应确保制度的合法性和合理性，充分考虑员工权益和感受，遵循公平、公正的原则。对于因特殊原因无法按时打卡的员工，应给予合理的解释和补救措施，如提供补卡机会或接受其他形式的出勤证明。
- 员工层面：应了解自己的权利和义务，在入职时仔细阅读并理解公司规章制度和劳动合同条款。如遇不公正待遇（如公司以打卡不规范为由非法扣减工资），应及时与公司协商解决；协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
综上所述，公司打卡不规范扣工资是否合法，需根据具体情况判断。如果你或你身边的人遇到了类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。