在工厂只有意外险的情况下出工伤，赔偿问题涉及多个方面，以下是详细解答：
一、意外险赔偿流程
报案：
- 员工在发生工伤后，应立即向所在单位报告，并由单位协助或员工自行向意外险的承保公司报案。报案时需提供事故发生的时间、地点、经过等基本情况。
收集理赔材料：
- 准备好医院出具的诊断证明、病历、检查报告等医疗资料，以及意外事故证明（如单位出具的事故经过说明、在场证人证言）和员工的身份证明。若涉及伤残，还需提供伤残鉴定报告。
申请理赔：
- 将收集齐全的理赔材料提交给保险公司，申请理赔。保险公司会对材料进行审核，并调查事故的真实性。
获得赔偿：
- 审核通过后，保险公司会按照保险合同约定的赔偿项目和金额进行赔付。赔偿项目通常包括医疗费用补偿、伤残赔付（根据伤残等级按合同约定的比例赔付）和身故赔偿（若工伤导致死亡）。
二、单位应承担的工伤赔偿责任
尽管单位只购买了意外险，但在工伤情况下，单位仍需承担部分赔偿责任，具体包括：
停工留薪期工资：
- 员工因工伤需暂停工作接受医疗的，单位应按月支付原工资福利待遇，停工留薪期一般不超过12个月，特殊情况可延长。
伤残津贴：
- 对于五级、六级伤残且难以安排工作的员工，单位应按月发给伤残津贴，具体比例根据伤残等级确定。
一次性伤残就业补助金：
- 若员工提出解除或终止劳动关系，单位应支付一次性伤残就业补助金，具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定。
三、注意事项与法律途径
了解合同条款：
- 员工应仔细阅读意外险的合同条款，了解赔偿标准和限制，以便在申请理赔时做到心中有数。
及时报案与提供证据：
- 及时向保险公司报案，并提供完整的证明材料，是保险公司审核赔偿申请的重要依据。
工伤保险的补充：
- 意外险不能替代工伤保险，单位应为员工缴纳工伤保险费，以提供更全面的保障。
法律途径：
- 如果单位拒绝承担工伤赔偿责任或对赔偿结果不满意，员工可以通过劳动仲裁或向法院起诉等法律途径来维护自己的合法权益。
综上所述，当员工在工厂发生工伤而单位仅为其购买了意外险时，员工应首先通过意外险获得赔偿，并同时关注单位应承担的工伤赔偿责任。为确保自己的权益得到充分保障，员工应及时报案、提供完整证明材料，并了解相关合同条款及赔偿限额。在必要时，可通过法律途径寻求更全面的赔偿。