关于您提到的集团两个工厂工时超过基本工时如何算加班的问题，首先我们要明确的是，加班的计算通常基于国家法律法规以及可能存在的企业内部规章制度。以下是对这一问题的详细解答：

1. 国家法律法规基础：

   • 在大多数国家和地区，包括我国，都有明确的劳动法规定，员工超出正常工作时间的工作应被视为加班，并应获得相应的加班费或调休。
   • 正常工作时间通常定义为每日8小时，每周40小时（或根据当地法律可能有所不同）。超出此范围的工作时间即视为加班。

2. 加班费的计算：

   • 加班费的具体计算方式可能因地区而异，但通常会根据员工的小时工资率乘以一定的倍数来确定。例如，在我国，工作日加班通常按不低于本人小时工资标准的1.5倍计算；休息日加班又不能安排补休的，通常按不低于本人日或小时工资标准的2倍计算；法定节假日加班则通常按不低于本人日或小时工资标准的3倍计算。

3. 企业内部规章制度：

   • 除了国家法律法规外，企业还可能制定自己的加班管理制度。这些制度可能会进一步细化加班的申请、审批、计算及支付方式等。
   • 因此，在计算加班时，也需要参考并遵守企业的具体规定。

4. 实际操作建议：

   • 首先，建议查阅并了解当地关于加班的法律法规，以及企业内部的加班管理制度。
   • 其次，确保员工的加班记录准确无误，包括加班时间、加班原因等，以便后续计算加班费或安排调休。
   • 最后，对于加班费的支付或调休的安排，应确保及时、足额，并符合法律法规和企业规定。

综上所述，工时超过基本工时的加班计算应基于国家法律法规和企业内部规章制度进行。如有任何具体疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。