留职能入职两家公司是否能被查出来，取决于多种因素，包括公司的背景调查力度、法律法规的监管、技术手段的应用等。以下是对此问题的详细分析：
一. 从公司背景调查角度分析
可能查出来的情况：
- 若新公司或当前公司委托专业的背景调查机构进行全面调查，这些机构可能通过查询社保缴纳记录、公积金缴存记录、银行工资流水等手段，发现员工在其他公司就职的情况。
- 在某些行业，公司间可能存在信息交流机制，用于共享员工信息。若两家公司属于同一行业且存在此类交流，员工兼职行为可能被揭露。
- 背景调查过程中，若联系到员工的前雇主、同事等证明人，他们可能提及员工在另一家公司的工作情况，导致兼职行为被发现。
不容易查出来的情况：
- 部分公司对新员工的背景调查不严格，仅进行基本的身份验证和学历核实，不涉及深入的工作经历调查，此时员工兼职较不易被发现。
- 若员工在另一家公司的工作经历短暂或信息管理不规范，背景调查机构可能难以获取完整信息，从而无法发现兼职情况。
二. 从法律法规和监管要求角度分析
- 社保和税务监管：虽然用人单位需为员工缴纳社保并代扣个税，但由于地区间社保和税务系统的联网程度和数据共享机制差异，可能并不会及时发现员工同时在两家公司任职的情况。然而，长期来看，重复参保和纳税申报异常仍有可能被察觉。
- 劳动法律法规约束：《劳动合同法》并未明确禁止员工在两家公司兼职，但规定若员工同时与其他用人单位建立劳动关系并对完成本单位工作任务造成严重影响，或经用人单位提出后拒不改正，用人单位有权解除劳动合同。因此，公司需有充分证据证明员工行为对工作造成了严重影响。
三. 从公司管理角度和技术手段分析
- 公司管理制度：公司可能要求员工提供离职证明、社保缴纳记录等材料以确认劳动关系解除情况。若员工隐瞒兼职情况，这些材料可能无法完全反映其真实就业状态。此外，公司内部的举报机制也可能导致兼职行为被揭露。
- 技术手段应用：随着信息技术的发展，部分企业可能利用大数据、人工智能等技术手段监测和分析员工工作行为和数据，从而发现潜在的兼职情况。但这种做法需考虑技术投入和合规性问题。
综上所述，留职能入职两家公司是否能被查出来是一个复杂的问题，涉及多个方面的因素。我建议员工在考虑兼职时应充分了解相关法律法规和公司政策，并确保自己的行为符合规定和要求，以避免潜在的法律风险和职业风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。