当农民工起诉总包单位索要工资时，总包单位应当从以下几个方面来应对：

1. 核实欠薪情况：

   • 首先，总包单位需要仔细核实农民工的欠薪情况，包括欠薪的具体金额、时间以及是否存在合理的欠薪理由。
   • 通过查阅合同、工资支付记录、考勤记录等证据材料，确保对欠薪事实有清晰、准确的了解。

2. 积极沟通协商：

   • 在核实欠薪情况后，总包单位应主动与农民工进行沟通，尝试通过协商的方式解决纠纷。
   • 可以提出分期支付、一次性结清或提供其他形式的补偿方案，以达成双方都能接受的解决方案。

3. 准备法律应诉：

   • 如果协商无果，农民工坚持起诉，总包单位需要积极准备法律应诉工作。
   • 聘请专业律师，收集并整理相关证据材料，包括合同、支付凭证、沟通记录等，以证明总包单位已经履行了支付工资的义务或存在合理的欠薪理由。
   • 律师将协助总包单位撰写答辩状，明确反驳农民工的诉讼请求，并准备在法庭上进行辩护。

4. 遵守法律程序：

   • 在整个诉讼过程中，总包单位应严格遵守法律程序，按时提交证据材料，参加庭审等。
   • 同时，也要尊重法院的判决结果，如果败诉，应按时履行支付义务；如果胜诉，也应尊重农民工的合法权益，不得进行不当的报复或刁难。

5. 加强内部管理：

   • 为了避免类似纠纷的再次发生，总包单位应加强内部管理，完善工资支付制度，确保农民工的工资能够按时、足额支付。
   • 同时，也要加强对农民工的法治宣传教育，提高他们的法律意识和维权能力。

总之，面对农民工起诉索要工资的情况，总包单位应保持冷静、理性的态度，积极应对并寻求合理的解决方案。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。