结论：劳动合同中写明双休但实际安排上六休一是否合法，需根据具体的工作时间安排、工时制度以及是否经过劳动行政部门批准等因素综合判断。在符合相关法律法规规定且保障劳动者休息权益的前提下，这样的安排可以是合法的。
详细分析：
基础法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是评估工作时间安排是否合法的基础标准。
- 同时，根据《中华人民共和国劳动法》第三十八条，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。这是保障劳动者休息权益的基本要求。
上六休一的合法性条件：
- 在标准工时制下，若劳动合同约定上六休一，但每天工作时间不超过8小时，且每周总工作时间不超过44小时，则此安排合法。例如，每日工作7小时，每周工作6天，总工时为42小时，这完全符合法律规定。
- 若因生产特点无法实行标准工时制，企业可向劳动行政部门申请实行综合计算工时工作制或不定时工作制。在这些工时制度下，上六休一的合法性需根据具体的工作时间安排和劳动行政部门的批准情况来判断。例如，在综合计算工时工作制下，只要在一个计算周期内（如周、月、季、年）的总工作时间未超过法定标准，且保证了劳动者的休息权利，上六休一的安排即可视为合法。
劳动者权益保护：
- 无论实行何种工时制度，用人单位都应严格遵守劳动合同中关于工作时间和休息休假的约定，不得擅自变更或违反。
- 如用人单位违反相关规定，劳动者有权依法维护自己的合法权益，包括要求支付加班费、调整工作时间安排等。例如，如果用人单位安排劳动者在休息日工作且未安排补休，则应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的百分之二百支付劳动者工资。
实际操作建议：
- 对于劳动者而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工作时间和休息休假的部分，确保自己的权益得到充分保障。
- 对于用人单位而言，在制定工作制度和安排工作时间时，应充分考虑劳动者的休息权益，确保符合相关法律法规的规定。同时，建议用人单位在制定相关条款时咨询专业的劳动法律顾问，以避免潜在的法律风险。
特殊情况说明：
- 如果劳动合同中虽然写明双休，但实际执行中却要求劳动者上六休一，且这种安排违反了法律法规的规定或损害了劳动者的休息权益，那么劳动者有权拒绝这种安排，并可以向劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
总结：
劳动合同中写明双休但实际安排上六休一并不必然违法，其合法性取决于具体的工作时间安排、工时制度以及是否经过劳动行政部门批准等因素。作为劳动者，应了解自己的合法权益，并在必要时依法维权；作为用人单位，应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的休息权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。