结论：脑梗住院期间未给单位提交假条，法定医疗期仍然受保护，但可能因未履行请假手续而面临单位依据内部规章制度进行的处理。以下从多个角度进行详细分析：

一、法定医疗期的保护性质

法定医疗期是法律为保障劳动者在患病或非因工负伤期间的基本权益而设定的，它不受劳动者是否提交假条等请假手续的影响。根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。这意味着，在医疗期内，用人单位不得随意解除劳动合同，且应支付劳动者病假工资或疾病救济费。

二、未提交假条的法律后果

虽然法定医疗期受保护，但劳动者在医疗期内仍需履行一定的义务，包括及时向单位报告病情、提交医疗证明等请假手续。如果劳动者未按照单位规定提交假条，可能面临以下后果：

1. 单位依据内部规章制度处理：

   • 许多单位都有明确的请假制度，要求劳动者在请假时提交相应的医疗证明或假条。如果劳动者未遵守这些规定，单位可能依据内部规章制度对其进行警告、扣发工资、甚至解除劳动合同（但需注意，在医疗期内解除劳动合同需符合法定条件，如劳动者严重违反单位规章制度等）。

2. 影响病假工资的支付：

   • 在一些情况下，单位可能要求劳动者提交假条作为支付病假工资的依据。如果劳动者未提交假条，单位可能拒绝支付或延迟支付病假工资。然而，这并不意味着劳动者在医疗期内不享有病假工资的权利，只是单位可能以此为由进行抗辩。

三、建议与应对措施

1. 及时补交假条：

   • 如果劳动者因故未能及时提交假条，应尽快与单位沟通并补交相关医疗证明。这有助于减少因未履行请假手续而可能面临的不利后果。

2. 了解单位规章制度：

   • 劳动者应了解并遵守单位的请假制度和其他相关规章制度。这有助于维护良好的劳动关系，避免不必要的纠纷。

3. 保留医疗证据：

   • 劳动者应妥善保留与病情相关的医疗证据，如诊断证明、病历、医疗费发票等。这些证据在后续可能发生的劳动争议中具有重要的证明作用。

4. 寻求法律帮助：

   • 如果劳动者与单位在医疗期、病假工资等方面发生争议，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以根据具体情况提供法律咨询和代理服务，帮助劳动者维护自己的合法权益。

四、特殊情况下的处理

如果劳动者因病情严重或紧急情况无法及时提交假条，且事后能够提供充分的医疗证明，单位通常应予以理解并补发病假工资。然而，这并不意味着劳动者可以完全忽视请假手续的重要性。在任何情况下，及时与单位沟通并履行请假手续都是维护良好劳动关系的关键。

总结：脑梗住院期间未给单位提交假条，法定医疗期仍然受保护，但劳动者应尽可能履行请假手续以避免不必要的纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。