结论：您描述的情况，在符合一定条件下，仍然有可能通过劳动仲裁来维护自己的权益。下面我将从多个角度为您详细分析。
一、关于自动离职的效力
如果自动离职协议非您真实意思表示：
- 若您能证明在签署自动离职协议时，公司存在欺诈、胁迫等行为，导致您并非出于真实意愿签署，那么该协议可能被认定为无效。根据《劳动合同法》的相关规定，无效的劳动合同或协议，自始没有法律约束力。
如果自动离职协议内容违法或显失公平：
- 若自动离职协议中的条款违反了法律法规的强制性规定，或者明显对一方不公平，该协议也可能被认定为无效或可撤销。例如，如果协议中剥夺了您应得的合法权益，如经济补偿金等。
二、关于劳动仲裁的可能性
仲裁请求的选择：
- 您可以选择以公司违法解除劳动合同为由，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。根据《劳动合同法》的规定，用人单位违法解除劳动合同的，应当向劳动者支付赔偿金，赔偿金的标准为经济补偿金的两倍。
- 或者，如果您认为自动离职协议无效或可撤销，您可以要求恢复劳动关系，并主张因公司行为导致的工资损失等。
证据的收集与提交：
- 在申请劳动仲裁时，您需要提供充分的证据来支持您的主张。这包括但不限于：劳动合同、工资单、自动离职协议、与公司沟通的记录（如邮件、短信、微信等）、证人证言等。
- 特别是要证明公司在签署自动离职协议时存在欺诈、胁迫等行为，或者协议内容违法或显失公平。
三、关于后续行动的建议
及时咨询并申请劳动仲裁：
- 鉴于劳动争议的时效性，我建议您尽快咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询），并在律师的指导下准备相关证据材料，及时向劳动仲裁委员会申请仲裁。
保持冷静与理性：
- 在处理此类纠纷时，保持冷静与理性至关重要。避免与公司发生不必要的冲突或争执，以免对您的权益造成进一步损害。
关注仲裁进展与结果：
- 在仲裁过程中，密切关注仲裁进展，及时配合仲裁委员会的调查与调解工作。如果仲裁结果不符合您的预期，您还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
最后，我想强调的是，每个劳动争议案件都有其独特性和复杂性。因此，在处理此类纠纷时，务必根据具体情况制定合适的策略，并在专业律师的指导下进行。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。