结论概述：
当个人同时从两个单位获得工资，且一个单位工资不足5000元，另一个单位超过5000元时，主要涉及的是个人所得税的缴纳问题，以及可能存在的劳动关系认定和社保缴纳问题。以下是对这些问题的详细分析。
一、个人所得税缴纳
综合所得计税：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，居民个人取得的工资、薪金所得属于综合所得，需要按纳税年度合并计算个人所得税。
- 因此，无论工资是从一个单位还是多个单位获得，都需要将全年所有工资、薪金所得合并计算，然后按照适用的税率和速算扣除数缴纳个人所得税。
税率和速算扣除数：
- 综合所得适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率。
- 具体税率和速算扣除数根据全年应纳税所得额来确定。例如，如果全年应纳税所得额在36000元至144000元之间，税率为10%，速算扣除数为2520元。
预扣预缴与汇算清缴：
- 每个单位在发放工资时，会按照税法规定进行预扣预缴个人所得税。
- 年度终了后，纳税人需要进行汇算清缴，将全年所有综合所得合并计算，多退少补。
二、劳动关系认定
全日制与非全日制：
- 如果个人同时与两个单位建立劳动关系，需要判断这些劳动关系是全日制的还是非全日制的。
- 全日制劳动关系通常意味着个人在一个单位全职工作，而与非全日制劳动关系则可能允许个人在多个单位兼职。
劳动合同与社保：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，建立劳动关系应当订立书面劳动合同。
- 如果个人与两个单位都建立了全日制劳动关系，那么两个单位都应当为其缴纳社会保险费。然而，在实际操作中，由于社保系统的限制，个人可能只能在一个单位参加社保。这种情况下，个人需要与两个单位协商解决社保缴纳问题，或者选择在一个单位参加社保，并确保另一个单位不重复缴纳。
法律风险：
- 如果个人同时与两个单位建立全日制劳动关系，但未告知其中一个单位，或者其中一个单位不知情，那么可能存在法律风险。例如，如果个人在一个单位工作期间受伤，而另一个单位不知情，那么受伤单位可能主张不承担工伤保险责任。
三、具体建议
了解税法规定：
- 个人应当了解个人所得税的缴纳规定，确保按时足额缴纳税款，避免税务风险。
明确劳动关系：
- 如果个人同时与两个单位建立劳动关系，应当明确劳动关系的性质（全日制或非全日制），并与两个单位协商解决社保缴纳等问题。
保留证据：
- 个人应当保留与两个单位签订的劳动合同、工资发放记录等证据，以备不时之需。
咨询专业人士：
- 如果个人对税法规定或劳动关系认定存在疑问，可以咨询专业律师或税务师，以获取更准确的法律意见和税务筹划建议。
示例说明：
假设个人A同时与单位X和单位Y建立劳动关系，单位X每月发放工资4000元，单位Y每月发放工资6000元。那么，个人A全年应纳税所得额为（4000+6000）*12=120000元（假设无其他扣除项）。根据个人所得税税率表，个人A应缴纳的个人所得税为：120000*10%-2520=9480元（此计算为简化示例，实际计算可能因具体扣除项而有所不同）。同时，个人A需要与单位X和单位Y协商解决社保缴纳等问题，并保留相关证据以备不时之需。
总结与进一步思考：
当个人同时从两个单位获得工资时，需要关注个人所得税的缴纳、劳动关系的认定以及社保的缴纳等问题。通过了解税法规定、明确劳动关系、保留证据以及咨询专业人士，个人可以更好地维护自己的合法权益并降低法律风险。如果你有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。