针对您提出的“员工少于30人，职工有残疾证怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，要明确的是，无论企业规模大小，持有残疾证的职工都是企业宝贵的资源，他们同样拥有独特的才华与价值，值得被平等对待并给予实现自我的机会。对于您企业中的残疾职工，您可以根据相关政策享受一定的优惠和支持。
一、残保金缴纳方面
免缴政策：根据政策规定，30人（含）以下的企业是暂免缴纳残疾人就业保障金（简称“残保金”）的。但这里需要注意的是，免缴并不等于免申报。您企业仍需在规定时间内完成零申报，以表明您已履行了相关义务，否则系统可能会判定为未履行申报义务，进而影响企业信用。
申报流程：您无需再进行独立的年审申报，只需在税务部门规定的申报期，通过电子税务局一次性完成安置残疾人情况的确认与残保金缴纳（即使为零申报）。系统会自动调用全国残疾人按比例就业情况联网认证数据核验，确保申报的准确性和便捷性。
二、税收优惠方面
企业所得税加计扣除：您企业在安置残疾人员后，除了可以按照支付给残疾职工的工资据实扣除外，还可以在计算应纳税所得额时，按照支付给残疾职工工资的100%进行加计扣除。这是一项显著的税收优惠，有助于降低企业的税负。
增值税限额即征即退：对于特定纳税人（如生产销售货物、提供加工、修理修配劳务等），如果其收入对应的增值税符合一定条件，还可以享受增值税限额即征即退的优惠。具体限额由各省、自治区、直辖市人民政府根据当地实际情况确定，但通常都有较高的退税额度。
其他费用减免：此外，根据当地政策，您企业还可能享受城镇土地使用税、城市基建费等其他费用的减免优惠。
三、实操细节方面
劳动合同签订：您必须与残疾职工签订1年以上（含）的劳动合同，以确保其就业的稳定性和合法性。短期合同或劳务合同等均不计入有效安置月数。
工资发放与社保缴纳：您需要按月足额支付不低于当地最低工资标准的工资给残疾职工，并为其足额缴纳社会保险（五险）。这是认定就业的核心凭证，也是享受相关优惠政策的必要条件。
特殊情形处理：如果残疾职工因工伤或长期病假无法到岗，只要劳动合同存续、社保正常缴纳、并按法律规定支付病假工资，即视为有效安置。您无需担心因此影响残保金的减免或税收优惠的享受。
四、风险警示
在享受政策优惠的同时，您也需要注意合规性。避免出现挂名、假用工等违规行为，这些行为一旦被查实，将面临补缴、滞纳金、罚款等严重后果，甚至可能影响企业的纳税信用评级和正常运营。
综上所述，对于您员工少于30人且持有残疾证的情况，您可以充分利用相关政策优惠来降低企业税负、提升企业形象，并确保残疾职工的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询当地税务或残联部门。