结论前置：
- 一般情况下，请假一天扣两天工资是不合法且不合理的。用人单位应仅扣除请假当天的工资，不得额外扣除或变相克扣其他工资。
- 若公司规章制度合法且合理，且请假情况符合规定，理论上可能存在特殊扣除情况，但实践中极少见且需严格符合法律条件。
法律规定与分析
工资支付的法律规定：
- 根据《工资支付暂行规定》，用人单位不得无故克扣劳动者工资。若因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 《中华人民共和国劳动法》同样规定，员工请事假时，用人单位应仅扣除请假当天的工资，不得额外扣除或变相克扣其他工资。
请假工资扣除的合理范围：
- 员工请假时，通常按照实际请假天数来扣除相应工资。计算公式为：日工资 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数（通常为21.75天），然后乘以请假天数得出应扣除的工资数额。
- 例如，若员工月工资为5000元，请事假1天，则应扣除的工资为：\(5000 \div 21.75 \approx 229.89\)元。若扣除两天工资，即扣除约459.78元，则明显超出了合理扣除范围，构成了对劳动者工资的克扣。
公司规章制度的合法性：
- 用人单位应依法制定规章制度，明确事假扣工资的标准和方式。规章制度应通过民主程序制定，向劳动者公示，并确保其内容不违反法律法规。
- 即使规章制度中明确规定了请一天事假扣两天工资，若该规定违反了法律法规的强制性规定（如导致员工工资低于最低工资标准），则该规定无效，用人单位仍需按照法律规定扣除工资。
劳动者的应对办法
与用人单位协商：
- 发现用人单位存在“请假一天扣两天工资”的情况时，劳动者应首先尝试与用人单位进行沟通协商，明确指出这种扣工资方式的不合法性，并要求单位按照正确方式计算和支付工资。
向劳动监察部门投诉：
- 若协商无果，劳动者可向当地劳动监察部门投诉举报。劳动监察部门有权对用人单位的工资支付情况进行监督检查，并会责令用人单位限期支付被克扣的工资。
申请劳动仲裁：
- 劳动者也可直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过仲裁程序要求用人单位支付被克扣的工资，并根据具体情况主张相应的经济补偿。
提起诉讼：
- 如对仲裁结果不满意，劳动者可在规定期限内向人民法院提起诉讼，通过司法途径维护自己的合法权益。
维权建议
- 在处理这类问题时，劳动者应保留好相关证据，如工资条、请假记录、与用人单位的沟通记录等，以便在需要时进行维权。
- 劳动者应了解并熟悉相关法律法规，增强自己的法律意识，以便更好地维护自己的合法权益。
总结：请假一天扣两天工资的做法在大多数情况下是不合法且不合理的。劳动者在遭遇此类情况时，应依法维权，确保自己的合法权益不受侵害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。