单位因学历低扣减工资一般不合法，劳动者可通过协商、投诉或仲裁等方式维权。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从法律规定角度
   根据《劳动法》和《劳动合同法》，工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。用人单位不得以学历为由，擅自降低劳动者工资标准。若劳动合同或单位规章制度中未明确约定“学历与工资挂钩”，且该约定不违反法律强制性规定，则单位扣减工资缺乏法律依据。
   例外情形：若劳动者在入职时与单位明确约定“学历为工资构成要素”（例如：合同中写明“本科学历工资为X元，专科学历为Y元”），且该约定不违反最低工资标准等强制性规定，则单位可能被认定为合法调整。但此类约定需劳动者签字确认，且单位需证明学历与岗位必要性存在直接关联。

2. 从操作程序角度
   即使单位主张“学历影响工资”，也需满足以下程序要求：

• 规章制度合法性：单位需证明扣减工资的依据（如内部规章制度）已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论），并向劳动者公示或告知；
  
• 举证责任：单位需提供证据证明“学历与岗位能力、绩效存在必然联系”（例如：岗位说明书中明确要求本科学历，且劳动者因学历不足无法完成工作任务）；
  
• 幅度限制：扣减工资后，劳动者实际工资不得低于当地最低工资标准。

1. 劳动者维权路径
   若单位违法扣减工资，劳动者可按以下步骤处理：
   

• 协商沟通：与单位人事或领导沟通，要求出具扣减工资的书面依据，并指出其违法性；
  
• 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉（可通过12333热线或官网），要求单位补发工资并接受行政处罚；
  
• 申请仲裁：若投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张单位支付工资差额及经济补偿金（若因此离职）。
  

建议：保留劳动合同、工资条、扣减通知等证据，维权时更有利。若需进一步分析具体情形，可向我提供更多细节（如合同条款、单位规章制度内容等），我会为你制定更精准的应对方案。