企业单位公司制度扣减工资是否合法，这并非一个简单的“是”或“否”的问题，而是需要综合考虑多个因素。以下是我从不同角度为你详细分析的情况：
合法的扣减工资情形
规章制度合法且经过民主程序制定
- 如果公司的扣减工资制度是通过民主程序制定的，比如经过了职工代表大会或全体职工的讨论，并与工会或职工代表进行了平等协商，且这些制度已经向员工进行了公示或告知，同时内容不违反法律法规的强制性规定，那么公司依据这些规章制度扣减员工工资是合法的。
- 举例：公司规定，员工因故意或重大过失给公司造成经济损失的，公司可以依据损失情况，从员工工资中合理扣除赔偿款项，但扣除比例不超过月工资的20%，且扣除后工资不低于当地最低工资标准。这样的规定，如果经过了民主程序制定并公示，就是合法的。
代扣代缴费用
- 公司有权根据法律规定，代扣员工的个人所得税、社会保险费用（个人负担部分）、法院判决或裁定中要求代扣的抚养费、赡养费等。这种扣减行为是基于法律义务的履行，因此是合法的。
赔偿经济损失
- 如果员工因个人原因给公司造成经济损失，公司可以按照劳动合同的约定要求其赔偿。但扣除的工资部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
绩效不达标
- 在绩效考核制度公平、公正且明确规定的情况下，如果员工的绩效工资被判定为不达标，公司可以合法扣减其绩效工资。但同样，扣减的比例和方式需要合理，不能侵犯员工的合法权益。
非法的扣减工资情形
规章制度未经法定程序制定
- 如果公司的扣减工资制度没有经过民主程序制定，也没有向员工公示或告知，那么该制度对员工不具有约束力。公司依据这样的制度扣减员工工资是不合法的。
扣减工资损害员工基本权益
- 公司随意克扣工资，导致员工工资低于当地最低工资标准，或者扣除工资的行为严重影响员工基本生活，均属于非法行为。
- 举例：公司以“员工表现不佳”为由，每月扣除员工工资的30%，导致员工实际收入低于当地最低工资标准。这样的行为就是非法的。
缺乏合理依据的扣减工资
- 公司没有合理、明确的理由，仅凭主观判断就扣减员工工资，也是不合法的。这种行为侵犯了员工的劳动报酬权。
- 举例：公司以“公司需要资金周转”为由，临时决定扣除所有员工工资的10%。这样的行为缺乏合理依据，是非法的。
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第二十五条、第九十一条明确规定了劳动者工资的保护和用人单位不得无故克扣劳动者工资的原则。
- 《工资支付暂行规定》第十六条进一步细化了用人单位可以代扣劳动者工资的情形以及扣减的限额，即因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
员工维权途径
如果员工认为公司扣减工资的行为不合法，可以采取以下措施来维护自己的权益：
- 与公司沟通协商：首先尝试与公司进行沟通，要求公司说明扣减工资的依据并提供相应证据。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，由其对公司的扣减行为进行调查和处理。
- 申请劳动仲裁：如果投诉仍未解决问题，员工可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
总结来说，企业单位公司制度扣减工资是否合法，取决于扣减的具体原因、公司制度的合法性以及是否遵守了相关法律法规。在任何情况下，公司都应遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。而员工在遭遇不合法扣减时，也应积极采取措施维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。