结论：保险公司按50%比例垫付医疗费是否合理，需分情况讨论，核心取决于保险合同约定、事故责任认定及当地司法实践，但通常情况下全责方保险公司的垫付比例应覆盖全部合理医疗费用，50%垫付可能存在不合理性。以下是具体分析：

一、从保险合同约定角度：需核查条款是否明确垫付比例

若对方投保的交强险或商业三者险合同中明确约定了“按比例垫付”条款（例如“保险公司根据事故责任比例垫付医疗费”），且该条款不违反法律强制性规定（如《保险法》第19条关于免除保险人依法应承担义务的条款无效的规定），则保险公司按50%垫付可能具有合同依据。
但需注意：交通事故中对方全责时，保险公司的赔偿义务是“全额覆盖合理损失”（《道路交通安全法》第76条），若合同条款将“垫付”与“最终赔偿”混同，或通过比例限制变相减轻赔偿责任，可能被认定为无效条款。此时您可要求保险公司按实际医疗费全额垫付。

二、从事故责任认定角度：全责方保险公司应承担全部合理医疗费

根据《机动车交通事故责任强制保险条例》第21条，交强险在责任限额内（医疗费用限额通常为1.8万元）不区分责任比例，需先行赔付受害人的医疗费；超出交强险限额的部分，由商业三者险按全责比例（100%）赔偿。
因此，若您的医疗费未超出交强险限额，保险公司应全额垫付；若超出限额，超出部分也应由商业三者险全额垫付。50%的垫付比例明显低于法定赔偿标准，除非保险公司能证明部分医疗费不合理（如过度治疗、非必要用药等），否则其垫付行为可能涉嫌违规。

三、从司法实践角度：法院通常不支持保险公司单方降低垫付比例

若保险公司以“内部规定”“风险控制”等理由单方决定按50%垫付，您可通过以下途径维权：

1. 向银保监会投诉：保险公司未按合同或法律规定履行垫付义务的，监管部门可责令其改正；
   
2. 起诉保险公司及全责方：要求法院判决保险公司全额赔偿医疗费，并由全责方承担连带责任（若保险公司赔付不足）。
   案例参考：某法院曾判决保险公司按100%比例垫付医疗费，理由为“保险合同未明确约定垫付比例，且全责方保险公司无权通过内部规定减轻法定赔偿义务”。

给您的小建议

1. 核查保险合同：要求对方提供保险单，重点查看“赔偿处理”“垫付条款”等内容；
   
2. 保留医疗证据：保存所有医疗费发票、病历、诊断证明等，证明费用的合理性；
   
3. 书面催告保险公司：若对方拒绝全额垫付，可发函要求其限期履行义务，并留存送达证据；
   
4. 及时咨询律师：若争议复杂（如涉及伤残鉴定、后续治疗费等），建议委托律师介入，通过诉讼或调解争取权益。
   

若您有进一步细节（如保险类型、医疗费金额、保险公司拒赔理由等），可随时告知我，我会为您分析具体应对方案。