结论：在实行综合计算工时工作制的周期内，即使未超过法定工作时间，员工在节假日上班仍然需要支付加班费。具体来说，法定节假日的加班费应按照不低于工资的百分之三百的标准支付。
一、综合计算工时制的定义与特点
综合计算工时工作制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用的以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。其特点在于，在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但平均日和周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。然而，这一制度并不改变法定节假日作为劳动者休息时间的法律性质。
二、法定节假日加班的法律规定
根据我国《劳动法》第四十四条的规定，用人单位在法定休假日安排劳动者工作的，应当支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这一规定具有普遍性，适用于所有工时制度，包括综合计算工时制。法定节假日是国家法律明确规定的劳动者休息时间，具有不可替代性，因此，无论劳动者在综合计算周期内的总工作时间是否超过法定标准，只要用人单位在法定节假日安排劳动者工作，就属于加班情形。
三、加班费的计算与支付
加班认定：在综合计算工时制下，法定节假日的工作时间并不计入综合计算周期内。因此，即使劳动者在综合计算周期内的总工作时间未超过法定标准，法定节假日工作的这部分时间也应认定为加班。
加班工资支付：用人单位需按照不低于劳动者本人日或小时工资的300%支付加班工资。加班工资的计算基数为劳动者本人小时工资，小时工资的计算方式为月工资收入除以月计薪天数（通常为21.75天）再除以8小时。具体计算公式如下：
其中，月计薪天数对应的总小时数 = 月计薪天数（21.75天）× 8小时/天。
四、实际操作中的注意事项
劳动合同约定：用人单位实行综合计算工时工作制，应在劳动合同中明确约定，并报劳动行政部门审批。劳动合同中应明确加班费的计算方式和支付标准，以避免后续纠纷。
加班记录保存：用人单位应妥善保存劳动者的加班记录，包括加班日期、加班时长、加班工资支付情况等，以备劳动行政部门检查或劳动者维权时使用。
劳动者权益保护：劳动者有权拒绝用人单位在法定节假日的加班要求（除非涉及公共利益、抢险救灾等紧急情况），并有权要求用人单位按照法律规定支付加班工资。
五、实例说明
假设某企业实行以月为周期的综合计算工时制，某员工月工资为5000元。在一个月份中，包含了1个法定节假日（如国庆节），且该员工在国庆节当天工作了8小时。即使该员工在该月份的总工作时间未超过法定标准，国庆节工作的这8小时也应认定为加班。该员工应得的法定节假日加班工资计算如下：
因此，该员工在国庆节当天工作应获得约689.76元的加班工资。
综上所述，实行综合计算工时工作制的员工在节假日上班，用人单位应依法支付加班工资，以保障劳动者的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。