在综合计算工时工作制下，遇到法定节假日上班的情况，加班费的计算需遵循特定的规则和步骤。以下是对这一问题的详细解答：

一、核心原则

在综合计算工时工作制中，加班费的计算以周期（如月、季、年）内的总工时为基准。若实际工作时间超出该周期的标准工时，超出部分需按150%支付加班费。而在法定节假日工作的，无论是否超出总工时，均需按300%额外支付加班费。

二、具体计算步骤

1. 确定周期总工时上限：

   • 根据周期（月、季、年）计算法定标准工作时间。例如，月度标准工时为20.83天×8小时/天=166.64小时。

2. 计算周期内实际工作时间：

   • 统计劳动者在该周期内的实际出勤工作小时数，包括法定节假日的工作时间。

3. 判断加班类型及时间：

   • 工作日延长工作时间：实际工作时间超过周期法定标准工作时间的部分。
   • 法定节假日加班：劳动者在法定节假日工作的时间，这部分时间无论是否超出总工时，均需单独计算加班费。

4. 计算小时工资：

   • 劳动者的小时工资 = 劳动合同约定的月工资标准 ÷ （月计薪天数21.75天 × 8小时）。例如，若月工资为5000元，则小时工资约为28.74元/小时。

5. 计算加班费：

   • 工作日加班费：小时工资 × 加班小时数 × 150%。
   • 法定节假日加班费：小时工资 × 法定节假日加班小时数 × 300%。

三、示例解析

以某员工为例，其月薪为5000元，实行以月为周期的综合计算工时工作制。在某一个月内，该员工实际工作了180小时，其中有法定节假日工作8小时。

1. 计算小时工资：

   • 小时工资 = 5000 ÷ （21.75 × 8）≈ 28.74元/小时。

2. 计算工作日延长工作时间的加班费：

   • 超出的工作时间 = 180 - 166.64 = 13.36小时。
   • 加点加班费 = 28.74 × 13.36 × 150% ≈ 579.3元。

3. 计算法定节假日的加班费：

   • 法定节假日加班费 = 28.74 × 8 × 300% = 690元。

4. 总加班费：

   • 总加班费 = 加点加班费 + 法定节假日加班费 = 579.3 + 690 = 1269.3元。

四、注意事项

1. 审批制度：实行综合计算工时工作制需经过劳动行政部门的审批，确保合法合规。

2. 健康保障：用人单位应在保障劳动者身体健康的基础上，合理安排工作时间，避免过度加班。

3. 加班时间限制：延长工作时间的小时数平均每月不得超过36小时，以保护劳动者的休息权。

4. 证据留存：劳动者应妥善保存考勤记录、排班表等证据，以便在主张加班费时提供有力支持。

5. 地区差异：对于休息日加班费的支付，可能存在地区差异，需参照当地法律法规或企业规定执行。但法定节假日的加班费支付标准是全国统一的。

综上所述，综合计算工时工作制下法定节假日上班的加班费计算需严格遵循相关法律法规的规定，并根据具体的工作时间和加班情况来确定。用人单位应确保合法合规地支付加班费，以保障劳动者的合法权益。