结论前置：扣实习生工资是否违法，需根据具体情况判断。一般情况下，未经法定程序或未征得实习生同意擅自扣除工资是违法的，但在特定情况下，如合同约定或经济损失赔偿等，扣除工资可能合法。
一、一般情况下的违法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，虽然实习生与用人单位之间可能未签订正式的劳动合同，但实习生提供的劳动同样应获得相应的报酬。实习协议或双方口头约定的报酬支付方式，一旦形成事实上的劳动关系或劳务关系，就具有一定的法律效力。用人单位无故克扣实习生工资，不仅违反了协议约定，也可能违反了民事法律中关于合同履行的相关规定。
违法情形：
- 如果用人单位未经法定程序，如未与实习生协商、未告知扣除原因等，或未征得实习生同意，就擅自扣除实习生工资，这通常被视为违法行为。实习生在提供正常劳务的情况下，单位随意克扣工资，无疑侵害了实习生获取劳动报酬的合法权益。
二、合法扣除工资的情形
合同约定：
- 如果实习协议或双方口头约定中明确规定了工资扣除的条件和标准，例如实习生违反单位规定造成损失时的赔偿方式，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么在符合约定条件时，用人单位可以依法扣除部分工资。但需要注意的是，扣除后的工资不得低于当地最低工资标准，以确保实习生的基本生活需求。
经济损失赔偿：
- 如果实习生因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，单位有权依据相关规定和约定扣除部分工资作为赔偿。但扣除的金额需合理，不得超过实习生当月工资的20%（具体比例可能因地区而异，需参照当地相关规定），且扣除后的工资同样不得低于当地最低工资标准。此外，单位需有充分证据证明损失的存在以及实习生的过错，否则可能构成违法扣除。
规章制度：
- 用人单位如果有明确、合理且已向实习生公示告知的规章制度，其中规定了可以扣除工资的情形，如迟到、早退、旷工等违反劳动纪律的行为，那么在这些情形发生时，用人单位可以依据规章制度扣除相应工资。但同样需要确保扣除行为符合规章制度的要求，且不得违反法律法规的强制性规定。
三、实习生的维权途径
协商与投诉：
- 实习生如果认为用人单位扣除工资的行为违法或不合理，应先与用人单位进行协商沟通，要求其说明扣工资的原因并解决问题。如果协商不成，实习生可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，实习生需要提供相关证据，如实习协议、工资条、扣除工资的通知等，以证明自己的主张。
法律支持：
- 在维权过程中，实习生如果遇到法律难题或需要更专业的法律建议，可以直接向我咨询。作为专业律师，我可以协助实习生分析案情、准备证据材料，并提供全面的法律支持，帮助实习生更好地维护自己的权益。
综上所述，扣实习生工资是否违法需根据具体情况判断。实习生应了解自己的权益，并在遇到问题时通过合法途径维护自己的利益。同时，用人单位也应遵守相关法律法规和合同约定，合理支付实习生工资，避免不必要的法律纠纷。