结论：已退休三年且单位未缴纳社保的情况下，能否申请劳动仲裁需分情况讨论，但通常已超过劳动仲裁时效，但可通过其他法律途径主张权益。

1. 关于劳动仲裁时效问题
   根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。您已退休三年，若退休时即发现单位未缴纳社保，则时效可能已届满，劳动仲裁机构可能不予受理。
   例外情形：若您能证明存在时效中断（如向单位主张权利、申请调解等）或中止（如因不可抗力无法主张权利）的情形，可尝试主张时效未届满，但需提供充分证据。

2. 社保权益的救济途径
   即使劳动仲裁时效已过，您仍可通过以下方式维护权益：

   • 向社保行政部门投诉：根据《社会保险法》第八十六条，用人单位未按时足额缴纳社保的，由社保征收机构责令限期缴纳或补足，并自欠缴之日起按日加收滞纳金。您可向当地社保局或税务局举报，要求单位补缴社保（需注意：补缴可能受当地政策限制，如补缴年限、滞纳金等）。
     
   • 主张经济补偿（有限情形）：若单位未缴纳社保导致您无法享受养老保险待遇，且符合《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第一条规定的情形（如因单位过错导致社保无法补缴），可向法院起诉要求单位赔偿损失。但需注意：此类案件需证明损失具体金额（如养老金差额），且法院裁判标准存在地域差异。

3. 实务建议

   • 优先协商：尝试与单位沟通，要求补缴社保或协商赔偿方案（如一次性补偿）。
     
   • 固定证据：收集劳动合同、工资流水、退休证明、社保缴费记录等材料，证明劳动关系及单位未缴费事实。
     
   • 及时行动：若选择投诉或诉讼，建议尽快启动程序，避免因拖延导致证据灭失或权利进一步受损。

总结：劳动仲裁可能因时效问题受限，但社保投诉和民事诉讼仍是可行途径。具体方案需结合您的证据情况、当地政策及司法实践综合判断，建议携带材料进一步咨询以制定策略。